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[求助]
Gaussion 加水进行优化计算出错，求高手进来看看啊，感激不尽,焦急阿
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一样的输入文件算法,但是对单体A和B分别计算错误不成功，奇怪的是，而对通过AUTODOCK对接得到的A和B的结合物C能计算成功，非常纳闷之中，请高手指点谢谢 附上输入文件 %chk=D:\xy\lv\danti\DMCDPM3h2o.chk %mem=500MB %rwf=d:\1,500mb,d:\2,500mb,d:\3,500mb,d:\4,500mb,d:\5,500mb # hf scrf=(ipcm,solvent=water) geom=connectivity 和出错的输出文件[ Last edited by fight1man on 2012-10-25 at 14:51 ] |
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2012-10-25 13:12:33, 60.26 K
2012-10-25 13:21:11, 11.51 K
2012-10-25 14:51:02, 64.05 K
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4楼2012-10-28 19:28:43
【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2012-10-26 12:20:38
fight1man: 金币+25, ★有帮助 2012-10-28 19:32:57
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gmy1990: 金币+3 2012-10-26 12:20:38
fight1man: 金币+25, ★有帮助 2012-10-28 19:32:57
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1、出错原因 (1)、BCDho.out 这个是自洽场(SCF)迭代不收敛，很多时候不太容易解决，可参照本版置顶帖Gaussian FAQ的2.3节的相关内容来解决。 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1566146 (2)、DM1010g2.out 这个是IPCM溶剂模型计算中迭代不收敛。 可以在关键词那一行（#打头）添加IOP(1/6=N)来解决，默认N=200，你的输出文件就是200循环还没有收敛出错。你可以设置的大一点。 2、建议。 你使用的计算方法(hf)太粗错，使得计算容易出各种问题。 你的体系应该是一个客体分子进入到环糊精的腔体中，属于弱相互作用，hf方法处理的实在是太差了，可以使用专用的处理弱相互作用的方法，比如B97D。 另外基组没有指定的话是使用sto-3g，也太粗糙，应该弱相互作用应该有极化函数（比如6-31G*），最好也有弥散函数(比如6-31+G*)。 即：建议使用B97D/6-31G*或者B97D/6-31+G*。不过你的体系有点大，带了加号算不动，先用前一种方法试试看吧。 |
2楼2012-10-25 20:16:28
sobereva
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2012-10-26 12:20:43
fight1man: 金币+25, ★有帮助, 谢谢啊，看来我得换理论方法基组看看了。可是我的体系要加水溶剂模型，您觉得我用哪个理论方法算比较合适啊。谢谢 2012-10-28 19:32:42
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2012-10-26 12:20:43
fight1man: 金币+25, ★有帮助, 谢谢啊，看来我得换理论方法基组看看了。可是我的体系要加水溶剂模型，您觉得我用哪个理论方法算比较合适啊。谢谢 2012-10-28 19:32:42
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你的问题出在IPCM溶剂模型计算中迭代不收敛。而且从 Iteration number XXX MaxDiff 后面的数值可以看出，越迭代距离收敛限越远，所以增加迭代次数是徒劳。 如果没有特别要求必须使用IPCM模型的话，建议将IPCM关键词改为PCM。 你计算时使用的理论方法和基组明显不合适，这在LS已经提到了。但这并非是导致出错的原因。 |
3楼2012-10-25 23:41:40
5楼2012-10-28 19:57:34