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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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wangjiaojiao

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何用MEGA软件进行MLVA分型的建树呢??

本来聚类分析是用BioNumerics的,但是太贵了,买不起。要去别的实验室借用,很麻烦。

最近看文献发现老外建树很多用MEGA就可以了。

但是MEGA的主要功能是做序列比对和分子进化分析的啊。

做MLVA分型,pcr之后跑毛细管电泳得到的结果整理出来是一堆重复序列的重复数,
比如一个菌株对应的3个VNTR位点的重复数分别是12 13 17,

整理出来的结果就是类似这样:
菌株1: 12 13 17 19 20 11 15
菌株2: 16 28 12 18 17 19 18
菌株3: 11 15 19 11 12 15 19
。。。 。。。

我想问的是,我怎么才能够把这堆数字导入MEGA软件中,构建聚类树呢?
如果不能直接导入,我应该做什么样的处理呢?

可能问题很简单,但是我这个菜鸟看了半天说明书还是是一头雾水啊~囧~~

求有经验的老师同学帮忙看看!谢谢!
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fffff123

禁虫 (初入文坛)

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2楼2017-11-15 09:33:57
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