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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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lmingshu

新虫 (小有名气)

[求助] Scan扫描

在寻找过渡态之前先做下SCAN 扫描,请问怎么做这个san扫描呢?输入文件是怎么样的?谢谢
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过渡态计算

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1楼 2012-10-22 21:59:53
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2012-10-25 22:50:49
lmingshu: 金币+8 2012-11-28 16:19:21
%chk=F:\c1.chk
# opt=modredundant hf/3-21g

Title Card Required

0 1
O                 -1.40350879   -0.32180660    0.00043877
H                 -1.72374137    0.58320739   -0.00043852
O                 -0.08350883   -0.32146739    0.00043848
H                  0.23672375   -1.22648138    0.00131599

D 2 1 3 4 S 180 1.000000
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2楼2012-10-23 14:00:35
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
2楼: Originally posted by lishijunzong at 2012-10-23 14:00:35
%chk=F:\c1.chk
# opt=modredundant hf/3-21g

Title Card Required

0 1
O                 -1.40350879   -0.32180660    0.00043877
H                 -1.72374137    0.58320739   -0.00043852
O   ...

其中，180是scan的步数，1.0000000是每步多少度。这个是二面角的D,2 1 3 4是原子编号。
若是键长B，键角用A
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3楼2012-10-23 14:08:41
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qianniandaxi

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
如果过渡态是单键断裂，形成两个分子的情况，可以考虑scan bond .
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4楼2012-10-25 21:47:27
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lingao

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by qianniandaxi at 2012-10-25 21:47:27
如果过渡态是单键断裂，形成两个分子的情况，可以考虑scan bond .

请问，这个scan bond 跟scan 在输入文件时有什么区别
赞一下 回复此楼
耐得了寂寞，拥得住繁华。。。
5楼2012-10-26 15:57:05
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qianniandaxi

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by lingao at 2012-10-26 15:57:05
请问，这个scan bond 跟scan 在输入文件时有什么区别...

scan bond是scan的时候选择bond这一项，设置相应的参数。这样输入文件就会出现相应的数据，不用你自己写。之前有人不是给你发了一个scan二面角的输入文件吗？输入文件中分子描述的下面一行数就是scan的内容。
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6楼2012-10-26 17:13:55
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