24小时热门版块排行榜    

查看: 671  |  回复: 5

lmingshu

新虫 (小有名气)

[求助] Scan扫描

在寻找过渡态之前先做下SCAN 扫描,请问怎么做这个san扫描呢?输入文件是怎么样的?谢谢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2012-10-25 22:50:49
lmingshu: 金币+8 2012-11-28 16:19:21
%chk=F:\c1.chk
# opt=modredundant hf/3-21g

Title Card Required

0 1
O                 -1.40350879   -0.32180660    0.00043877
H                 -1.72374137    0.58320739   -0.00043852
O                 -0.08350883   -0.32146739    0.00043848
H                  0.23672375   -1.22648138    0.00131599

D 2 1 3 4 S 180 1.000000
2楼2012-10-23 14:00:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
2楼: Originally posted by lishijunzong at 2012-10-23 14:00:35
%chk=F:\c1.chk
# opt=modredundant hf/3-21g

Title Card Required

0 1
O                 -1.40350879   -0.32180660    0.00043877
H                 -1.72374137    0.58320739   -0.00043852
O   ...

其中,180是scan的步数,1.0000000是每步多少度。这个是二面角的D,2 1 3 4是原子编号。
若是键长B,键角用A
3楼2012-10-23 14:08:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qianniandaxi

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
如果过渡态是单键断裂,形成两个分子的情况,可以考虑scan bond .
4楼2012-10-25 21:47:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lingao

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by qianniandaxi at 2012-10-25 21:47:27
如果过渡态是单键断裂,形成两个分子的情况,可以考虑scan bond .

请问,这个scan bond 跟scan 在输入文件时有什么区别
耐得了寂寞,拥得住繁华。。。
5楼2012-10-26 15:57:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qianniandaxi

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by lingao at 2012-10-26 15:57:05
请问,这个scan bond 跟scan 在输入文件时有什么区别...

scan bond是scan的时候选择bond这一项,设置相应的参数。这样输入文件就会出现相应的数据,不用你自己写。之前有人不是给你发了一个scan二面角的输入文件吗?输入文件中分子描述的下面一行数就是scan的内容。
6楼2012-10-26 17:13:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lmingshu 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[论文投稿] 十年后又回来了,论文投稿求助 +4 哈哈114477 2026-08-01 4/200 2026-08-07 14:39 by jgy194592
[基金申请] 听说今天filecode变了 +22 布布和一二 2026-08-06 45/2250 2026-08-07 14:14 by 日月天地
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +4 yang182083 2026-08-06 6/300 2026-08-07 12:43 by 虫友是什么虫
[基金申请] 面上再次挂了,太难了,躺也躺不了,倦也卷不过,小学校之殇! +23 低垂的野花 2026-07-31 31/1550 2026-08-07 12:22 by speculiar
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] 基金中了 +11 laoda193707 2026-08-06 11/550 2026-08-07 10:54 by TT和NN
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +4 archvillain 2026-08-06 8/400 2026-08-07 08:06 by 带你看大海
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[考博] 【2027博士申请】纳米药物递送方向 20+3 13586093586 2026-08-03 4/200 2026-08-05 09:59 by lfy8008
[基金申请] 有没有H口的?有收到消息的吗? +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 面上提前没消息,有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 18/900 2026-08-04 14:42 by archvillain
[基金申请] 娱乐 +4 Tide man 2026-08-03 4/200 2026-08-04 11:51 by wgch518
[基金申请] 什么时候能放榜呀? +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
请填处理意见