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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 新手vasp安装求助
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lzlgcdc

金虫 (正式写手)

[求助] 新手vasp安装求助

c@c-VirtualBox:~/vasp/vasp.5.lib$ cp makefile.linux_ifc_P4 makefile
c@c-VirtualBox:~/vasp/vasp.5.lib$ make
gcc -E -P -C preclib.F >preclib.f
ifort -O0 -FI -FR  -c preclib.f
cc -O -c timing_.c
cc -O -c derrf_.c
cc -O -c dclock_.c
gcc -E -P -C diolib.F >diolib.f
ifort -O0 -FI -FR  -c diolib.f
gcc -E -P -C dlexlib.F >dlexlib.f
ifort -O0 -FI -FR  -c dlexlib.f
gcc -E -P -C drdatab.F >drdatab.f
ifort -O0 -FI -FR  -c drdatab.f
ifort -O0 -FI  -c lapack_double.f
lapack_double.f(10179): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXTSCALAR
-------------------------^
lapack_double.f(10181): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXT SCALAR
--------------------------^
lapack_double.f(20692): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXTSCALAR
-------------------------^
lapack_double.f(20694): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXT SCALAR
--------------------------^
lapack_double.f(20706): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$             NEXTSCALAR
----------------------------^
lapack_double.f(20708): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$             NEXT SCALAR
-----------------------------^
lapack_double.f(20733): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXTSCALAR
-------------------------^
lapack_double.f(20735): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXT SCALAR
--------------------------^
ifort -O0 -FI  -c linpack_double.f
ifort -O0 -FI  -c lapack_atlas.f
lapack_atlas.f(12864): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXTSCALAR
-------------------------^
lapack_atlas.f(12866): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXT SCALAR
--------------------------^
lapack_atlas.f(18861): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXTSCALAR
-------------------------^
lapack_atlas.f(18863): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXT SCALAR
--------------------------^
lapack_atlas.f(18875): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$             NEXTSCALAR
----------------------------^
lapack_atlas.f(18877): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$             NEXT SCALAR
-----------------------------^
lapack_atlas.f(18902): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXTSCALAR
-------------------------^
lapack_atlas.f(18904): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXT SCALAR
--------------------------^
rm libdmy.a
rm: 无法删除"libdmy.a": 没有那个文件或目录
make: [libdmy.a] 错误 1 (忽略)
ar vq libdmy.a preclib.o timing_.o derrf_.o dclock_.o  diolib.o dlexlib.o drdatab.o
ar: creating libdmy.a
a - preclib.o
a - timing_.o
a - derrf_.o
a - dclock_.o
a - diolib.o
a - dlexlib.o
a - drdatab.o


已经生成libdmy.a   高手帮我看看整个过程中5140那些是否会影响后面对vasp的编译
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1楼2012-10-22 15:05:02
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lzlgcdc

金虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by souledge at 2012-10-23 08:55:30
没有关系，都这样~
最好的检验方式就是全编译之后，运行个计算试试。

我看别人的没有这个部分……
lapack_double.f(10179): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXTSCALAR
-------------------------^
lapack_double.f(10181): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXT SCALAR
--------------------------^
lapack_double.f(20692): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXTSCALAR
-------------------------^
lapack_double.f(20694): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXT SCALAR
--------------------------^
lapack_double.f(20706): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$             NEXTSCALAR
----------------------------^
lapack_double.f(20708): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$             NEXT SCALAR
-----------------------------^
lapack_double.f(20733): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXTSCALAR
-------------------------^
lapack_double.f(20735): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXT SCALAR
--------------------------^
ifort -O0 -FI  -c linpack_double.f
ifort -O0 -FI  -c lapack_atlas.f
lapack_atlas.f(12864): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXTSCALAR
-------------------------^
lapack_atlas.f(12866): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXT SCALAR
--------------------------^
lapack_atlas.f(18861): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXTSCALAR
-------------------------^
lapack_atlas.f(18863): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXT SCALAR
--------------------------^
lapack_atlas.f(18875): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$             NEXTSCALAR
----------------------------^
lapack_atlas.f(18877): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$             NEXT SCALAR
-----------------------------^
lapack_atlas.f(18902): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXTSCALAR
-------------------------^
lapack_atlas.f(18904): remark #5140: Unrecognized directive
CDIR$          NEXT SCALAR
--------------------------^
然后我编译5.2的makefile的时候出现的是：LAPACK= ../vasp.5.lib/lapack_double.o

make后出现如下问题：
…………………………………………………………
lapack_double.f:(.text+0x801ea): undefined reference to `dgemv_'
lapack_double.f:(.text+0x802ed): undefined reference to `dgemv_'
lapack_double.f:(.text+0x80549): undefined reference to `dgemv_'
lapack_double.f:(.text+0x80658): undefined reference to `dgemv_'
lapack_double.f:(.text+0x80770): undefined reference to `dgemv_'
../vasp.5.lib/lapack_double.o:lapack_double.f:(.text+0x8087f): more undefined references to `dgemv_' follow
../vasp.5.lib/lapack_double.o: In function `dlabrd_':
lapack_double.f:(.text+0x80a14): undefined reference to `dscal_'
lapack_double.f:(.text+0x80b21): undefined reference to `dgemv_'
lapack_double.f:(.text+0x80c3b): undefined reference to `dgemv_'
lapack_double.f:(.text+0x80eae): undefined reference to `dgemv_'
lapack_double.f:(.text+0x80fb0): undefined reference to `dgemv_'
lapack_double.f:(.text+0x810b1): undefined reference to `dgemv_'
../vasp.5.lib/lapack_double.o:lapack_double.f:(.text+0x811ba): more undefined references to `dgemv_' follow
../vasp.5.lib/lapack_double.o: In function `dlabrd_':
lapack_double.f:(.text+0x81341): undefined reference to `dscal_'
lapack_double.f:(.text+0x81480): undefined reference to `dgemv_'
lapack_double.f:(.text+0x81581): undefined reference to `dgemv_'
lapack_double.f:(.text+0x817d9): undefined reference to `dgemv_'
lapack_double.f:(.text+0x818e7): undefined reference to `dgemv_'
lapack_double.f:(.text+0x819ff): undefined reference to `dgemv_'
../vasp.5.lib/lapack_double.o:lapack_double.f:(.text+0x81b07): more undefined references to `dgemv_' follow
../vasp.5.lib/lapack_double.o: In function `dlabrd_':
lapack_double.f:(.text+0x81ca0): undefined reference to `dscal_'
lapack_double.f:(.text+0x81dbd): undefined reference to `dgemv_'
lapack_double.f:(.text+0x81ec4): undefined reference to `dgemv_'
lapack_double.f:(.text+0x82127): undefined reference to `dgemv_'
lapack_double.f:(.text+0x82233): undefined reference to `dgemv_'
lapack_double.f:(.text+0x8233f): undefined reference to `dgemv_'
../vasp.5.lib/lapack_double.o:lapack_double.f:(.text+0x82440): more undefined references to `dgemv_' follow
../vasp.5.lib/lapack_double.o: In function `dlabrd_':
lapack_double.f:(.text+0x825b8): undefined reference to `dscal_'
../vasp.5.lib/lapack_double.o: In function `dlasq1_':
lapack_double.f:(.text+0x82cb7): undefined reference to `dcopy_'
lapack_double.f:(.text+0x82d02): undefined reference to `dcopy_'
../vasp.5.lib/lapack_double.o: In function `dorgl2_':
lapack_double.f:(.text+0x88f36): undefined reference to `dscal_'
make: *** [vasp] Error 1

大侠帮我看看该怎么解决  谢谢
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4楼2012-10-23 13:00:22
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普通回帖

lzlgcdc

金虫 (正式写手)
高手求指导  急救啊
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2楼2012-10-23 00:24:49
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souledge

专家顾问 (著名写手)
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流， 2012-10-23 09:53:48
没有关系，都这样~
最好的检验方式就是全编译之后，运行个计算试试。
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lzlgcdc
思想重于技巧，内涵重于表象
3楼2012-10-23 08:55:30
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liliangfang

荣誉版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lzlgcdc: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 谢谢大侠 2013-04-19 17:21:35
首先编译一下，如果有make: [libdmy.a] 错误 1 (忽略)

可以执行rm *.o
然后在make
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lzlgcdc
5楼2012-10-23 21:14:38
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lzlgcdc

金虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by liliangfang at 2012-10-23 21:14:38
首先编译一下，如果有make:  错误 1 (忽略)

可以执行rm *.o
然后在make

得到libdmy.a了，大侠你的意思是在5.lib下删除.o的文件吗？接着在vasp.5下make？

还有我现在就是ifort 和自带的mkl  把mkl里的fftw3xf 用make libia32 compiler=gnu 后得到libfftw3xf-gnu.a文件放入到……/mkl/lib/ia32下了

在.bashrc中 设置为source /opt/intel/composer_xe_2013.0.079/bin/compilervars.sh ia32
source /opt/intel/composer_xe_2013.0.079/mkl/bin/mklvars.sh ia32
后面就是把5.2中的makefile  改为FC=ifort  
把BLAS=  /opt/libs/libgoto/libgoto.so 删去了
把 LAPACK= ../vasp.5.lib/lapack_double.o删去了
# mkl.10.0
# set -DRPROMU_DGEMV  -DRACCMU_DGEMV in the CPP lines
#BLAS=-L/opt/intel/mkl100/lib/em64t -lmkl -lpthread
此处加上mkl的路径
在 # use the mkl Intel lapack
#LAPACK= -lmkl_lapack 后面加上 mkl的路径

这样串行有问题吗？  两个问题麻烦大侠了
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6楼2012-10-23 23:32:09
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lzlgcdc

金虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by liliangfang at 2012-10-23 21:14:38
首先编译一下，如果有make:  错误 1 (忽略)

可以执行rm *.o
然后在make

大侠我在得到libdmy.a后，在lib下rm *.o 后继续在lib下make   结果重复了最开始的状态  没有得到.so文件……   是什么问题呢 ？
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7楼2012-10-24 00:21:10
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liliangfang

荣誉版主 (著名写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by lzlgcdc at 2012-10-24 00:21:10
大侠我在得到libdmy.a后，在lib下rm *.o 后继续在lib下make   结果重复了最开始的状态  没有得到.so文件……   是什么问题呢 ？...

浣犵紪璇戠殑鏃跺�欒鎸夌収涓�涓暀绋嬶紝涓?瑕?鐢ㄥソ鍑犱釜浜虹殑锛屽氨涓?浼氭湁杩欐牱鐨勯棶棰樹簡
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8楼2012-10-24 08:23:44
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lzlgcdc

金虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by liliangfang at 2012-10-24 08:23:44
浣犵紪璇戠殑鏃跺�欒鎸夌収涓�涓暀绋嬶紝涓?瑕?鐢ㄥソ鍑犱釜浜虹殑锛屽氨涓?浼氭湁杩欐牱鐨勯棶棰樹簡...

乱码？ 我的意思是在5.lib下得到libdmy.a   紧接着rm *.a  最后再执行make      lib下会得到.so的文件吗   我之前看过一篇帖子有你的回答 上面意思是这样 ……
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9楼2012-10-24 09:42:29
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liliangfang

荣誉版主 (著名写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by lzlgcdc at 2012-10-24 09:42:29
乱码？ 我的意思是在5.lib下得到libdmy.a   紧接着rm *.a  最后再执行make      lib下会得到.so的文件吗   我之前看过一篇帖子有你的回答 上面意思是这样 ……...

不好意思，什么的是说你要安装同一个版本的编译教程编译，就不会提出上面的问题了，如果你用mkl的库你就去看看zhangguangping的帖子，出现小问题那是正常的，多调试几次就好了。
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4601283&page=1#pid1
论坛里面有好多教程
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10楼2012-10-24 10:25:12
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