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huyingdamon

银虫 (小有名气)


[求助] 真心求助

我装另外Gromacs装好久也不会,官网上看了几遍也不会,因为有计算机语言不懂,我是win7系统,好像更难装,后来经同学介绍认识一个会gromacs的,他网上传给我4.5.4版的,我说都不用安装什么的就能用了啊,他说这是编译好的,我也不太懂。Gromacs软件包里有一个water的例子,我照着做几步后,到了这步Since all the neccesary files are available, we are going to preprocess the input files to create a run input (.tpr) file. This run input file is the only input file for the MD-program mdrun.

grompp -v   

Now it's time to start the simulation of 20 picoseconds.

mdrun -v   

After the MD simulation is finished, it is possible to view the trajectory with the ngmx program:

我找不到输入文件,之后不会弄了,希望热心的朋友们能够帮下我,十分感谢了
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Gromacs

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huyingdamon

银虫 (小有名气)


首先很感谢哈,因为真的是开始什么都不知道
3楼2012-10-17 18:21:23
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-10-17 19:03:00
你就不会看看本版下面的资源帖?有好多入门资料的。

实在不会问问google “gromacs 入门”,也有好多,还有gromacs官网上面也有例子教程。
PS 装个linux吧,MD模拟一般都在linux系统下。
2楼2012-10-16 21:41:14
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-10-18 11:13:50
huyingdamon: 金币+1, 有帮助 2012-10-18 11:51:47
引用回帖:
3楼: Originally posted by huyingdamon at 2012-10-17 18:21:23
首先很感谢哈,因为真的是开始什么都不知道

ok
从这里开始吧:加油:

http://www.mdbbs.org/thread-9940-1-1.html
http://www.mdbbs.org/thread-1163-1-1.html
http://www.mdbbs.org/thread-4215-1-1.html
4楼2012-10-17 19:01:45
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huyingdamon

银虫 (小有名气)


引用回帖:
4楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-10-17 19:01:45
ok
从这里开始吧:加油:

http://www.mdbbs.org/thread-9940-1-1.html
http://www.mdbbs.org/thread-1163-1-1.html
http://www.mdbbs.org/thread-4215-1-1.html...

我想多跟您交流下,能加我QQ982886526吗,谢谢了
5楼2012-10-18 11:52:52
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