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iriskye

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[求助] 转基因小鼠鉴定southern blot探针设计

准备用了pTRE2载体插入了单端融合EGFP的目的基因,做注射时切下tet启动子到polyA的序列。现在需要设计southern blot的探针,没做过southern blot,网上看看原理是挺好懂的,但是不知道探针要多长(我现在考虑是200~500左右),设计在哪里。

我放到小鼠里的是人的基因,但是这个基因和小鼠的同源性非常高,基本一模一样。当然我也可以把探针设计到EGFP那里,但我总觉得能杂交到目的基因最好。我放进去的是cDNA序列,小鼠的内源基因有内含子,但是外显子基本是100~150bp左右的,这个长度会杂交出信号么?

另外,我设计的探针应该跨过消化基因组DNA的限制性内切酶位点么?这一点我有些不大明白。

请教各位了。谢谢!
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