24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 3742  |  回复: 19
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

sesy

木虫 (小有名气)

[求助] 请教高斯09算溶剂效应及能量校正问题,多送金币+小红花

我们这级新接触Gaussion09,看小木虫中有很多帖子说09和03做能量校正得到的输出结果不一样,所以请教高手看看我用09算的方法对不对,尤其是输入文件写的有问题吗?我先优化完结构然后做单点能和溶剂效应,输入文件如下,请之前用过09的虫友们多多指点。多送金币+小红花 希望大家多多关注,急求解答!!!

一、使用G09程序包,先用小基组b3lyp/6-31g(d)对构型进行优化和频率分析,
输入文件关键词 :# opt freq b3lyp/6-31g(d) geom=connectivity
输出结果选用的 Thermal correction to Gibbs Free Energy=  (用A表示)

二、再用大基组计算单点能:# b3lyp/6-311++g(d,p) scf=tight
输出结果选用的 SCF Done:  E(RB3LYP) =  -1246.14645414(用B表示)

三、最后考虑到溶剂效应:
输入文件# b3lyp/6-311++g(d,p) scf=tight scrf=(PCM,solvent=benzene,read,smd,Dovacuum,ExternalIteration)



Radii=uaks (最后)

输出结果选用的 DeltaG (solv)    (kcal/mol) =     -38.40 (用C表示)

最后自由能表示:自由能=自由能校正(A)+单点能(B)+溶剂化能(C)

请大家看看我这样做对不对,还有不对的话应该怎样写输入文件?多谢大家。。。
回复此楼
Fighting!!!
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sesy

木虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by goodmood660 at 2012-10-11 18:35:42
第二步 二、再用大基组计算单点能:# b3lyp/6-311++g(d,p) scf=tight
输出结果选用的 SCF Done:  E(RB3LYP) =  -1246.14645414(用B表示)
是没有必要算的,只算一三步就行。
最后自由能表示:自由能=自由能校 ...

阁下看看我们计算g09溶剂化下的单点能的输入文件对不对啊?我看了一下,第三步out文件里有好几个SCF Done:  E(RB3LYP) = 这一项的能量都不一样啊。。。
请问阁下做的溶剂化下的单点能的输入文件是什么?
Fighting!!!
9楼2012-10-11 20:02:33
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 20 个回答

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
sesy: 金币+1, 有帮助 2012-10-11 14:29:14
楼主确定能打印DeltaG (solv)    (kcal/mol) =     -38.40?,我尝试过几次,用G03可以的,g09不能直接打印
2楼2012-10-11 12:00:09
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sesy

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lishijunzong at 2012-10-11 12:00:09
楼主确定能打印DeltaG (solv)    (kcal/mol) =     -38.40?,我尝试过几次,用G03可以的,g09不能直接打印

是的,不知阁下用不用09?看看我的关键词和计算公式对吗?我就是按照这个关键词这样做的,我没用过03,我优化用的09,所以能量必须也得用09 ,不知这样校正对不对?谢谢
Fighting!!!
3楼2012-10-11 14:31:55
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sesy

木虫 (小有名气)

有木有研究09的大师们??? 赶紧来帮帮忙吧。。。。只是帮偶看一下这样做对不对?我有将近100个结构,已经算了一半了。。。急求解答 金币全送您、、、
Fighting!!!
4楼2012-10-11 14:41:21
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 297,工科调剂? +5 河南农业大学-能 2026-04-14 5/250 2026-04-18 15:17 by Equinoxhua
[考研] 急需调剂 +9 绝不放弃22 2026-04-15 10/500 2026-04-18 08:09 by chixmc
[考研] 一志愿中科大材料与化工,353分还有调剂学校吗 +10 否极泰来2026 2026-04-15 12/600 2026-04-17 17:54 by mapenggao
[考研] 291求调剂 +9 关忆北. 2026-04-14 9/450 2026-04-16 22:49 by cfdbai
[考研] 300求调剂 +11 橙a777 2026-04-15 11/550 2026-04-16 22:43 by cfdbai
[考研] 一志愿沪9,生物学326求调剂 +9 刘墨墨 2026-04-15 9/450 2026-04-16 17:14 by 崔崔崔cccc
[考研] 322求调剂 +8 123安康 2026-04-12 15/750 2026-04-16 11:07 by Espannnnnol
[考研] 求调剂推荐 +8 小聂爱学习 2026-04-14 8/400 2026-04-16 07:22 by 学员JpLReM
[考研] 289 分105500药学专硕求调剂(找B区学校) +4 白云123456789 2026-04-13 4/200 2026-04-16 00:18 by 粉沁若尘
[考研] 药学求调剂 +11 RussHu 2026-04-12 13/650 2026-04-15 19:07 by zhuwenxu
[考研] 085801电气专硕272求调剂 +19 电气李 2026-04-13 21/1050 2026-04-15 13:37 by 黑科技矿业
[考研] 310求调剂 +16 666真好 2026-04-11 18/900 2026-04-15 13:28 by 黑科技矿业
[考研] 297工科调剂? +14 河南农业大学-能 2026-04-13 15/750 2026-04-15 13:25 by 黑科技矿业
[考研] 考研调剂 +13 长弓傲 2026-04-13 14/700 2026-04-14 14:44 by zs92450
[考研] 食品与营养(0955)271求调剂 +15 升格阿达 2026-04-12 16/800 2026-04-14 13:18 by 浮若_安生
[考研] 一志愿中南大学 0855 机械 286 求调剂 +11 不会吃肉 2026-04-12 11/550 2026-04-13 21:59 by bljnqdcc
[考研] 297工科,求调剂? +13 河南农业大学-能 2026-04-12 13/650 2026-04-13 14:12 by dingyanbo1
[考研] 一志愿浙大生物325分求调剂 +9 zysheng 2026-04-12 9/450 2026-04-12 22:31 by yuyin1233
[考研] 344 材料专业 求调剂211 无地域要求 +8 hualkop 2026-04-11 8/400 2026-04-12 22:24 by fqwang
信息提示
请填处理意见