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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 在MS中建造石墨烯的周期性结构，如何得到立方形的盒子
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voleyes

银虫 (正式写手)

[求助] 在MS中建造石墨烯的周期性结构，如何得到立方形的盒子

导入graphite后得到的是个菱形的盒子，我想建一个立方盒子，然后导入gromacs进行模拟，怎么做啊？
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1楼2012-10-10 17:21:03
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梦里梦幻

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by mxiangying at 2012-10-12 13:55:35
built- symmetry- rebuild lattice
自己计算一组正交的基矢输入即可。...

什么是正交的基矢？怎么算?可以 举个例子吗？
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12楼2016-09-30 11:04:19
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-10-12 15:52:34
建立一个大一些的菱形盒子，然后切成立方体不就行了
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2楼2012-10-10 21:30:15
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smx07131301

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-11 14:10:07
你可以通过lattice参数栏，改γ角为90度，相应的边长也应变长
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坚持就是胜利！
3楼2012-10-11 08:06:06
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voleyes

银虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by smx07131301 at 2012-10-11 08:06:06
你可以通过lattice参数栏，改γ角为90度，相应的边长也应变长

改了角度之后，整个结构变形了，压扁了
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4楼2012-10-11 19:44:59
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