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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白质等电点计算 题目解答
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
引用回帖:
20楼: Originally posted by 蓝染1046 at 2012-10-15 14:26:26
谢谢老师，很高兴能遇见您。学生按您的指导做这题：计算Lys-Ala-Glu-Gly-Glu 的等电点，已知Lys 的α-氨基的pKa 为8.95，ε-氨基的pKa 为10.53，Glu 的α-羧基的pKa 为2.19，γ-羧基的pKa 为4.25。————R+ + ,  ...

全部的解离过程为R2+，R+，R0，R-，R2-。对应的PK依次为2.19,4.25,8.95,10.53，现在明白了吗，取兼性离子两侧PK算术平均值，对于前面那个题是最后一步为兼性离子，对于本题是第二步解离呀，正确答案为（4.25+8.95）/2=6.6.
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21楼2012-10-16 15:24:46
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
引用回帖:
20楼: Originally posted by 蓝染1046 at 2012-10-15 14:26:26
谢谢老师，很高兴能遇见您。学生按您的指导做这题：计算Lys-Ala-Glu-Gly-Glu 的等电点，已知Lys 的α-氨基的pKa 为8.95，ε-氨基的pKa 为10.53，Glu 的α-羧基的pKa 为2.19，γ-羧基的pKa 为4.25。————R+ + ,  ...

log[(1/2)/(1/2)]不应该出现，因为没有两个一样的解离基团，前面那个题目中有一样解离程度的基团，本题中没有一样的解离基团呀
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22楼2012-10-16 15:35:53
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
引用回帖:
21楼: Originally posted by zhouxj at 2012-10-16 15:24:46
全部的解离过程为R2+，R+，R0，R-，R2-。对应的PK依次为2.19,4.25,8.95,10.53，现在明白了吗，取兼性离子两侧PK算术平均值，对于前面那个题是最后一步为兼性离子，对于本题是第二步解离呀，正确答案为（4.25+8.95） ...

是第二步和第三步之间呀，前面打错了
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23楼2012-10-16 15:49:32
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
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20楼: Originally posted by 蓝染1046 at 2012-10-15 14:26:26
谢谢老师，很高兴能遇见您。学生按您的指导做这题：计算Lys-Ala-Glu-Gly-Glu 的等电点，已知Lys 的α-氨基的pKa 为8.95，ε-氨基的pKa 为10.53，Glu 的α-羧基的pKa 为2.19，γ-羧基的pKa 为4.25。————R+ + ,  ...

这样计算有点问题，我重新考虑，答案应该就是3.22，肽的等电点和氨基酸等电点不一样，会尽快给你回复 望理解 晚上要上课
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24楼2012-10-16 18:38:26
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
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20楼: Originally posted by 蓝染1046 at 2012-10-15 14:26:26
谢谢老师，很高兴能遇见您。学生按您的指导做这题：计算Lys-Ala-Glu-Gly-Glu 的等电点，已知Lys 的α-氨基的pKa 为8.95，ε-氨基的pKa 为10.53，Glu 的α-羧基的pKa 为2.19，γ-羧基的pKa 为4.25。————R+ + ,  ...

下午上课前忙着给你恢回复了，结果少算了碳末端的Y羧基，导致结果有误（上课路上突然想到不是两个酸性，一个碱性怎么结果接警中性吗），上完课马上给你回复了我计算有误的消息不知道你看见了没有，晚上又上了两节课，现在正式回答你，你的计算正确，是4.25
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25楼2012-10-16 23:00:30
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
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20楼: Originally posted by 蓝染1046 at 2012-10-15 14:26:26
谢谢老师，很高兴能遇见您。学生按您的指导做这题：计算Lys-Ala-Glu-Gly-Glu 的等电点，已知Lys 的α-氨基的pKa 为8.95，ε-氨基的pKa 为10.53，Glu 的α-羧基的pKa 为2.19，γ-羧基的pKa 为4.25。————R+ + ,  ...

我特意的在http://www.innovagen.se/custom-p ... erty-calculator.asp网上上检查了一下，提供答案是4.26，再次证明我们的计算没有错误 ，希望你考研顺利，愉快。
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26楼2012-10-16 23:02:50
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
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20楼: Originally posted by 蓝染1046 at 2012-10-15 14:26:26
谢谢老师，很高兴能遇见您。学生按您的指导做这题：计算Lys-Ala-Glu-Gly-Glu 的等电点，已知Lys 的α-氨基的pKa 为8.95，ε-氨基的pKa 为10.53，Glu 的α-羧基的pKa 为2.19，γ-羧基的pKa 为4.25。————R+ + ,  ...

借用别人的一句话回答你更好理解“正电荷是两个，负电荷是三个，如果要保持相等，只能是两个谷氨酸的侧链带有1/2电荷。”
这是前面那个三肽的别人更好的解释“等电点是总电荷为零的状态，那么就不应该按单个赖氨酸来计算，而是应该将3个放在一起，就是说一个氨基，一个羧基，加上3个赖氨酸侧链总电荷为零。因为lys是碱性AA，在等电点状态下，氨基解离质子不带电，羧基带一个负电荷，那么每个侧链就说三分之一解离。既是带三分之一正电荷。根据Handerson-Hasselbalch公式，此时PH=PKa+lgp[质子受体]/[质子供体]=10.54+lg2”
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27楼2012-10-16 23:12:34
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
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22楼: Originally posted by zhouxj at 2012-10-16 15:35:53
log不应该出现，因为没有两个一样的解离基团，前面那个题目中有一样解离程度的基团，本题中没有一样的解离基团呀...

看错了，把碳末端的那个Y羧基忘记了
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28楼2012-10-16 23:17:52
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
第三题给你找到了答案：要计算多肽的等电点，首先应该找到静电荷为零的分子状态。在此多肽中最多可以带有（30＋1）个单位负电荷，而正电荷最多只有（15＋10＋1）个，相差了5个电荷。要想让正负电荷数相等，只能让30个羧基（侧链－COOHpK＝4.3）少带5个负电荷（－COOHpK＝3.5，它比侧链－COOH易于解离，难于接受质子），即在30个侧链－COOH中有25个处于解离状态（－COO－），5个不解离（－COOH）。因此：pH＝pKa＋lg（[碱]/[酸]）＝4.3＋lg（25/5）＝5.0。
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29楼2012-10-16 23:27:18
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
第三题的答案是10.53+lg0.5=10.23
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30楼2012-10-16 23:47:02
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