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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白质等电点计算 题目解答
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 龙儿无双 at 2012-10-09 08:06:55
解释一下怎么算的啊，光给个答案有啥用

lys二肽计算：由于没有明显的无兼性离子，所以可将R++-变为R+/2 +/2 -，及相当于50%解离，则PI=PKa=10.53；后者同样处理 将R+++-变为R+/3 +/3 +/3 -,计算ph=pka+log（2/3）/（1/3）=10.53+log2=10.83
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11楼2012-10-10 21:52:40
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
wizardfan: 金币+3, 态度值得鼓励 2012-10-11 06:38:26
从早晨到现在上了一天课程，12个小时课程了，我很累，所以写的比较简单，望谅解，如果还不明白，我愿意再次提供帮助。前天的回答比较简单，望二位理解
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12楼2012-10-10 21:54:30
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蓝染1046

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
10楼: Originally posted by zhouxj at 2012-10-10 21:52:33
lys二肽计算：由于没有明显的无兼性离子，所以可将R++-变为R+/2 +/2 -，及相当于50%解离，则PI=PKa=10.53；后者同样处理 将R+++-变为R+/3 +/3 +/3 -,计算ph=pka+log（2/3）/（1/3）=10.53+log2=10.83...

谢谢，金币送了。说实话，并不是很明白这个步骤，ph=pka+log（2/3）/（1/3）=10.53+log2=10.83用的应该是Handerson的公式可是R++-变为R+/2 +/2 -是什么意思；为什么是半解离；质子受体和质子供体为什么是2和1，没有算α-c和α-N？此前一点没接触过这种题，问题幼稚，给您添麻烦了
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13楼2012-10-11 18:14:21
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
引用回帖:
13楼: Originally posted by 蓝染1046 at 2012-10-11 18:14:21
谢谢，金币送了。说实话，并不是很明白这个步骤，ph=pka+log（2/3）/（1/3）=10.53+log2=10.83用的应该是Handerson的公式可是R++-变为R+/2 +/2 -是什么意思；为什么是半解离；质子受体和质子供体为什么是2和1，没有 ...

等电点时候羧基为负电荷，N末端去质子化，不带电荷，既然是等电点则只能是侧链带正电荷，三个侧链接力是一样的，故只能个解离1/3，才能满足等电点条件。等电点时候体体为1/3（即兼性离子），受体即解离生成的受体为2/3（即带一个单位负电荷形式）
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14楼2012-10-11 19:49:47
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
等电点时候羧基为负电荷，N末端去质子化，不带电荷，既然是等电点则只能是侧链带正电荷，三个侧链接力是一样的，故只能个解离1/3，才能满足等电点条件。等电点时候体体为1/3（即兼性离子），受体即解离生成的受体为2/3（即带一个单位负电荷形式）
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15楼2012-10-11 19:49:56
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
至于前者，道理一样，只能各自解离一半才能满足等电点这个条件，而且二者解离度是一样的，只能各自50%，代入公式计算也是10.53+lg（1/2）/（1/2）=10.53
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蓝染1046
16楼2012-10-11 19:51:36
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蓝染1046

铁虫 (初入文坛)
送鲜花一朵
引用回帖:
16楼: Originally posted by zhouxj at 2012-10-11 19:51:36
至于前者，道理一样，只能各自解离一半才能满足等电点这个条件，而且二者解离度是一样的，只能各自50%，代入公式计算也是10.53+lg（1/2）/（1/2）=10.53

真佩服您了，因该是很好的大学吧，呵呵。我今年考研想考复旦，知道自己差很多，但是想搏一把。这样的问题却到处找不到答案。用Handerson-Hasselbalch公式我知道一个这样的算法：“等电点是总电荷为零的状态，那么就不应该按单个赖氨酸来计算，而是应该将3个放在一起，就是说一个氨基，一个羧基，加上3个赖氨酸侧链总电荷为零。因为lys是碱性AA，在等电点状态下，氨基不带电，羧基带一个负电荷，那么每个侧链就说三分之一解离。既是带三分之一正电荷。根据Handerson-Hasselbalch公式，此时PH=PKa+lgp[质子受体]/[质子供体]=.....”和您的是一样的，但这个算法我最不明白的地方是Handerson-Hasselbalch公式用法：1、题干中Lys的α-氨基的 pKa 2.18，pkb 8.95,pkε 10.53有三个pk值，为什么用了最后一个？因为lys是碱性？等电点也是碱性的？那第二个也是碱性的呀？....2、三个lys有4个氨基1个羧基其中侧链2个未解离氨基+主链氨基+失质子的主链羧基都可以是质子受体啊，为什么算的时候没有考虑主链？？...3、像Arg有两个氨基  His有一个咪唑基 他们作为质子供体还是受体呢？算几个呢？
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17楼2012-10-12 20:39:01
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
wizardfan: 金币+3, BioEPI+1, 感谢非常详细的回答 2012-10-13 03:48:29
1 Handerson-Hasselbalch公式中的pka可以对应的是任一PH条件下的当前解离基团pk值，当等电点时，ph=pi=pka+lg[质子受体]/[质子供体]，而PI与兼性离子两侧的PK值有关，而兼性离子出现在最后一步解离之间，建议你写出具体的解离简式R+++，R+++-，R++-，R-，明白了吗，就是第三个和第四个之间，三个lys同上分析，希望你好运。2肽链在0-14不解离，见王镜岩上册第三版164页倒数第三行最后几句话，只有两侧游离的碳末端和氮末端参与解离，其余的以肽键予以“中和”，祝你好运。3你写出解离简式就明白那个是供体那个是受体，比如咪唑基，即可以作为供体也可以作为受体。相见上册134页下面lys和glu解离过程图，我对学生的要求是要快速写出解离简式，祝你好运
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18楼2012-10-12 21:15:34
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zhouxj

至尊木虫 (文坛精英)
引用回帖:
17楼: Originally posted by 蓝染1046 at 2012-10-12 20:39:01
真佩服您了，因该是很好的大学吧，呵呵。我今年考研想考复旦，知道自己差很多，但是想搏一把。这样的问题却到处找不到答案。用Handerson-Hasselbalch公式我知道一个这样的算法：“等电点是总电荷为零的状态，那么就 ...

1 Handerson-Hasselbalch公式中的pka可以对应的是任一PH条件下的当前解离基团pk值，当等电点时，ph=pi=pka+lg[质子受体]/[质子供体]，而PI与兼性离子两侧的PK值有关，而兼性离子出现在最后一步解离之间，建议你写出具体的解离简式R+++，R+++-，R++-，R-，明白了吗，就是第三个和第四个之间，三个lys同上分析，希望你好运。2肽链在0-14不解离，见王镜岩上册第三版164页倒数第三行最后几句话，只有两侧游离的碳末端和氮末端参与解离，其余的以肽键予以“中和”，祝你好运。3你写出解离简式就明白那个是供体那个是受体，比如咪唑基，即可以作为供体也可以作为受体。相见上册134页下面lys和glu解离过程图，我对学生的要求是要快速写出解离简式，祝你好运
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19楼2012-10-12 21:17:01
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蓝染1046

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
18楼: Originally posted by zhouxj at 2012-10-12 21:15:34
1 Handerson-Hasselbalch公式中的pka可以对应的是任一PH条件下的当前解离基团pk值，当等电点时，ph=pi=pka+lg/，而PI与兼性离子两侧的PK值有关，而兼性离子出现在最后一步解离之间，建议你写出具体的解离简式R+++， ...

谢谢老师，很高兴能遇见您。学生按您的指导做这题：计算Lys-Ala-Glu-Gly-Glu 的等电点，已知Lys 的α-氨基的pKa 为8.95，ε-氨基的pKa 为10.53，Glu 的α-羧基的pKa 为2.19，γ-羧基的pKa 为4.25。————R+ + , R+ + - , R+ + - - - .这样等电点在后两个状态之间，两个y-羧基半解离即pI=pka+log[(1/2)/(1/2)]=4.25.  ————可一看答案这样写：pI=0.5[（P+）+(p-)  ]=3.22            不解？？？
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20楼2012-10-15 14:26:26
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