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香樟树2011

新虫 (初入文坛)

[求助] clustal软件怎样使用啊，有相关教程吗

初接触生物信息学，需要对蛋白质氨基酸进行序列分析，不知道怎样做。
输入比对序列是怎样输入呢？
总之，各种不懂啊
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1楼 2012-10-08 11:24:21
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seq.cn

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
1949stone: 回帖置顶 2012-10-08 16:42:56
Clustal的使用总结（Clustalx+Clustalw）
Clustal包括Clustalx和Clustalw（前者是图形化界面版本后者是命令界面），是生物信息学常用的多序列比对工具。

最近要针对人、小鼠、大鼠、猴进行siRNA药物设计，其中要用到多序列比对的显示结果。我选用了Clustal，使用时的记录如下：
1.官方下载地址：http://www.clustal.org/download/current/，下载linux版本clustalw-2.1.tar.gz
2，解压并安装  $ ./configure $ make $ make install
3,运行多序列比对 clustalw2 -INFILE=test.fa  -OUTPUT=CLUSTAL -OUTFILE=test.out -SEQNOS=ON
BY bdc_0100 seq.cn
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5楼2012-10-08 15:58:57
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gwd0312

木虫 (正式写手)

“无冕之王”

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-10-08 14:06:38
1949stone: 回帖置顶 2012-10-08 16:42:39
1949stone: 可以详细说一下 他的功能还有一些 2012-10-08 16:43:38
我用的是英文版的，现将序列分析过程解释如下：
首先点击clustalx.exe打开程序；点击File---Load sequences载入序列（序列格式要求是文本文档）；
接下来点击Alignment-----Do Complete Alignment，弹出对话框之后点击align就OK了。
有什么问题欢迎继续交流！
赞一下(1人) 回复此楼
持之以恒、永不放弃！
2楼2012-10-08 12:43:53
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香樟树2011

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by gwd0312 at 2012-10-08 12:43:53
我用的是英文版的，现将序列分析过程解释如下：
首先点击clustalx.exe打开程序；点击File---Load sequences载入序列（序列格式要求是文本文档）；
接下来点击Alignment-----Do Complete Alignment，弹出对话框之后 ...

谢谢，不过我还没有这个软件，请问在哪里可以下载呢？普通的电脑系统就可以安装吗？
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3楼2012-10-08 13:46:04
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
1949stone: 金币+1, good 2012-10-08 16:42:52
到这里下载，http://www.clustal.org/。软件使用不难，按照2楼提示的做就行了。
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4楼2012-10-08 14:46:33
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