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香樟树2011

新虫 (初入文坛)

[求助] clustal软件怎样使用啊,有相关教程吗

初接触生物信息学,需要对蛋白质氨基酸进行序列分析,不知道怎样做。
输入比对序列是怎样输入呢?
总之,各种不懂啊
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
1949stone: 金币+1, good 2012-10-08 16:42:52
到这里下载,http://www.clustal.org/。软件使用不难,按照2楼提示的做就行了。
4楼2012-10-08 14:46:33
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查看全部 5 个回答

gwd0312

木虫 (正式写手)

“无冕之王”

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-10-08 14:06:38
1949stone: 回帖置顶 2012-10-08 16:42:39
1949stone: 可以详细说一下 他的功能还有一些 2012-10-08 16:43:38
我用的是英文版的,现将序列分析过程解释如下:
首先点击clustalx.exe打开程序;点击File---Load sequences载入序列(序列格式要求是文本文档);
接下来点击Alignment-----Do Complete Alignment,弹出对话框之后点击align就OK了。
有什么问题欢迎继续交流!
持之以恒、永不放弃!
2楼2012-10-08 12:43:53
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香樟树2011

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gwd0312 at 2012-10-08 12:43:53
我用的是英文版的,现将序列分析过程解释如下:
首先点击clustalx.exe打开程序;点击File---Load sequences载入序列(序列格式要求是文本文档);
接下来点击Alignment-----Do Complete Alignment,弹出对话框之后 ...

谢谢,不过我还没有这个软件,请问在哪里可以下载呢?普通的电脑系统就可以安装吗?
3楼2012-10-08 13:46:04
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seq.cn

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
1949stone: 回帖置顶 2012-10-08 16:42:56
Clustal的使用总结(Clustalx+Clustalw)
Clustal包括Clustalx和Clustalw(前者是图形化界面版本后者是命令界面),是生物信息学常用的多序列比对工具。

最近要针对人、小鼠、大鼠、猴进行siRNA药物设计,其中要用到多序列比对的显示结果。我选用了Clustal,使用时的记录如下:
1.官方下载地址:http://www.clustal.org/download/current/,下载linux版本clustalw-2.1.tar.gz
2,解压并安装  $ ./configure $ make $ make install
3,运行多序列比对 clustalw2 -INFILE=test.fa  -OUTPUT=CLUSTAL -OUTFILE=test.out -SEQNOS=ON
BY bdc_0100 seq.cn
5楼2012-10-08 15:58:57
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