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lhazrael

木虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by wenzonglu at 2012-10-08 14:06:48
1.实验室做分子很少，qPCR更没做过，感觉做rt-pcr已经很崩溃了，再摸索估计耗很长时间，看的相关文章也有直接做RT-PCR的，能不能绕过不做qPCR啊？
RT-PCR的图片是可以的，不知道你文章是否有类似的话：PCR product ...

对了，听实验室人将不按照审稿人的意见改的话很有可能会被拒掉啊，如果只解释会不会很悬啊
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11楼2012-10-08 19:47:14
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lhazrael

木虫 (正式写手)
刚发现这杂志上今年年初的一篇文章RNA干扰后也是用RT-PCR检测，人家咋就可以呢？
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12楼2012-10-08 20:49:16
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lhazrael

木虫 (正式写手)
审稿人的意见必须要采纳吗？是不是不采纳只有被拒的命运？
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13楼2012-10-08 20:58:36
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wenzonglu

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
lhazrael: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-10-08 22:57:48
引用回帖:
10楼: Originally posted by lhazrael at 2012-10-08 19:35:24
非常感谢您的回复，还想再问一下:
第一个问题里，我没讲那句话，如果在文章中补上的话是不是要把软件分析条带亮度的具体数据写上去呢？
第二个问题我没有做定量RT-PCR呀，请问复制数怎么算？（接触的比较少，可能 ...

呵呵，楼主文章中没有提到我上述的话PCR products were ......... photographed under ultraviolet illumination. Total gray were estimated by Glyko BandScan 4.5 for RT-PCR products, and the data were presented as the ratio of samples densitometric units to the β-actin 当然不行啦，难怪审稿人会质疑数据结果（尽管肉眼看差异显著，统计学要求数据统计不是肉眼观察统计，呵呵，轻松一下）。补上之后，软件分析条带亮度的具体数据必需有而且还要有误差值（可参考附件图，横坐标是各个基因，没有参考基因(⊙o⊙)哦）。

审稿人说的是定量RT-PCR的复制数数据，你没做当然没有啦（你的数据是相对灰度值，就是软件分析条带亮度的具体数据，每个基因比上参考基因值，数值一般不超过1的）。

你目前只能这样修改后投稿，就算拒稿也是很快，要么就是接收，总之风险各占一半，楼主自己掂量吧。

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14楼2012-10-08 22:43:10
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lhazrael

木虫 (正式写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by wenzonglu at 2012-10-08 22:43:10
呵呵，楼主文章中没有提到我上述的话PCR products were ......... photographed under ultraviolet illumination. Total gray were estimated by Glyko BandScan 4.5 for RT-PCR products, and the data were pres ...

呵呵，可能我看的文章少了，我看的文章做这个的好像没有贴过软件分析的结果，所以也就没想过要贴上去。我记得当时分析用的是Image J不是您提到的Glyko BandScan 4.5，不知行不行？
不还是不补，我再考虑考虑，纠结纠结，谢谢你了
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15楼2012-10-08 23:03:36
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lhazrael

木虫 (正式写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by wenzonglu at 2012-10-08 22:43:10
呵呵，楼主文章中没有提到我上述的话PCR products were ......... photographed under ultraviolet illumination. Total gray were estimated by Glyko BandScan 4.5 for RT-PCR products, and the data were pres ...

不好意思，麻烦再问下，附件图中横坐标是各个基因，我就一个基因，然后加个内参，是不是就可以横坐标是各个突变菌菌名，纵坐标是相对表达量了呢？另外确认下相对表达量的意思是目的基因表达量与内参基因表达量的比值吗？
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16楼2012-10-08 23:14:30
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wenzonglu

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
lhazrael: 金币+3, ★★★很有帮助, 谢谢 2012-10-09 14:00:11
Image J统计也可以啊，那也得有数据结果的。”横坐标是各个突变菌菌名，纵坐标是相对表达量“、”相对表达量的意思是目的基因表达量与内参基因表达量的比值“，正确！
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17楼2012-10-09 09:34:21
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lhazrael

木虫 (正式写手)
引用回帖:
17楼: Originally posted by wenzonglu at 2012-10-09 09:34:21
Image J统计也可以啊，那也得有数据结果的。”横坐标是各个突变菌菌名，纵坐标是相对表达量“、”相对表达量的意思是目的基因表达量与内参基因表达量的比值“，正确！

麻烦帮忙看一下，审稿人的意见是不是必须做绝对定量啊还是相对定量也行？
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18楼2012-10-09 17:19:20
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wenzonglu

木虫 (正式写手)
“ I would strongly urge the authors to use qPCR to determine 。。。。。。”审稿人力陈使用定量PCR，所以才说有风险啊！楼主自己掂量~\(≧▽≦)/~啦啦啦
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19楼2012-10-09 17:32:56
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lhazrael

木虫 (正式写手)
引用回帖:
19楼: Originally posted by wenzonglu at 2012-10-09 17:32:56
“ I would strongly urge the authors to use qPCR to determine 。。。。。。”审稿人力陈使用定量PCR，所以才说有风险啊！楼主自己掂量~\(≧▽≦)/~啦啦啦

那如果做的话做绝对定量啊还是相对定量呢？
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20楼2012-10-09 21:21:55
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