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mws19870629

新虫 (初入文坛)

[求助] 小弟不才,求大神们解决以下CIF问题

请大神帮忙实际解答一下下面这几类问题,谢谢
Alert level A
PLAT722_ALERT_1_A Angle   Calc      113.00, Rep      109.50 Dev...       3.50 Deg.
              C39  -C38  -H38B    1.555   1.555   1.555      #        145      
________________________________________
Alert level B
PLAT093_ALERT_1_B No su's on H-atoms, but refinement reported as .      mixed     
PLAT722_ALERT_1_B Angle   Calc      111.00, Rep     114(10) Dev...       3.00 Deg.
              C40  -C39  -C38     1.555   1.555   1.555      #        149      
PLAT722_ALERT_1_B Angle   Calc      117.00, Rep      119.80 Dev...       2.80 Deg.
              C39' -C44' -H44'    1.555   1.555   1.555      #        187      
________________________________________
Alert level C
PLAT241_ALERT_2_C Check High      Ueq as Compared to Neighbors for         O3     
PLAT341_ALERT_3_C Low Bond Precision on  C-C Bonds ...............     0.0101 Ang  
PLAT722_ALERT_1_C Angle   Calc      122.00, Rep      120.10 Dev...       1.90 Deg.
              C39  -C40  -H40     1.555   1.555   1.555      #        151      
PLAT722_ALERT_1_C Angle   Calc      119.00, Rep      120.30 Dev...       1.30 Deg.
              C39' -C40' -H40'    1.555   1.555   1.555      #        175      
PLAT723_ALERT_1_C Torsion Calc     -116.00, Rep    -112(14) Dev...       4.00 Sigma
              O4  -C38 -C39 -C44    1.555   1.555   1.555   1.555     113      
PLAT723_ALERT_1_C Torsion Calc        4.00, Rep      -1(17) Dev...       5.00 Sigma
              C44 -C39 -C40 -C41    1.555   1.555   1.555   1.555     115      
PLAT723_ALERT_1_C Torsion Calc       -2.00, Rep       4(18) Dev...       6.00 Sigma
              C40 -C39 -C44 -C43    1.555   1.555   1.555   1.555     120      
PLAT723_ALERT_1_C Torsion Calc        1.00, Rep      -1(16) Dev...       2.00 Sigma
              C44'-C39'-C40'-C41'   1.555   1.555   1.555   1.555     127      
PLAT723_ALERT_1_C Torsion Calc        3.00, Rep       5(16) Dev...       2.00 Sigma
              C40'-C39'-C44'-C43'   1.555   1.555   1.555   1.555     132      
________________________________________
Alert level G
PLAT005_ALERT_5_G No _iucr_refine_instructions_details in CIF ....          ?
PLAT242_ALERT_2_G Check Low       Ueq as Compared to Neighbors for       C39'     
PLAT301_ALERT_3_G Note: Main Residue  Disorder ...................         13 Perc.
PLAT710_ALERT_4_G Delete 1-2-3 or 2-3-4 Linear Torsion Angle ... #          3     
            N3  -CU1 -N1  -C1    -93.00  3.00   1.555   1.555   1.555   1.555  
PLAT710_ALERT_4_G Delete 1-2-3 or 2-3-4 Linear Torsion Angle ... #          6     
            N3  -CU1 -N1  -C8     91.00  3.00   1.555   1.555   1.555   1.555  
PLAT710_ALERT_4_G Delete 1-2-3 or 2-3-4 Linear Torsion Angle ... #          9     
            N1  -CU1 -N3  -C23  -118.00  3.00   1.555   1.555   1.555   1.555  
PLAT710_ALERT_4_G Delete 1-2-3 or 2-3-4 Linear Torsion Angle ... #         12     
            N1  -CU1 -N3  -C30    72.00  4.00   1.555   1.555   1.555   1.555  
PLAT779_ALERT_4_G Suspect or Irrelevant (Bond) Angle in CIF .... #         20     
              C38' -O4   -C38     1.555   1.555   1.555             35.80 Deg.

小弟再次感谢各位大神了
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luxtal

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
mws19870629: 金币+1, ★★★很有帮助 2012-10-05 19:50:33
问题不大,一个A类错误,显示H38B的位置有问题,删了再重加即可。
另一个B类错误,搜索'mixed” 替换成"constr"就行。
What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg
2楼2012-10-05 02:57:53
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涟漪笑笑

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
感觉一楼是高手啊!
孤松倒挂依绝壁,千金散尽还复来。
3楼2012-10-05 13:52:05
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