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321wangke321金虫 (正式写手)
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文献中的疑问：做过PSSM的请进
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以拟南芥ERF蛋白的保守域氨基酸搜索genebank和swissport数据库，下载E值<10-10的所有序列。根据这些不同物种的ERF序列构建ERF结构域的位置特异得分矩阵（PSSM），通过PSI-TBLASTN，以ERF的PSSM搜索整个葡萄的EST库（摘自文献中一段话）。 问题1：如何获得不同物种序列的PSSM？ 问题2：得到PSSM之后应该用什么算法搜索EST库？PSI-TBLASTN现在好像没有了 |
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