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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 药学 » 药物分析 » 请教一个代谢组学SCI修回的问题~高手请进
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fangang1111

木虫 (著名写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by shuizhao at 2012-10-07 21:15:42
谢谢你的解答哈，你说的第一种方法我在文章中已经做了，然后你说的第二种方法是要另外做实验，相当于是要建立定量的方法了，是吗？...

你已经用第一种方法补充做了，那就应该可以了哈，第二种方法就是从新做实验，建立定量方法验证了，工作量有点大，可以不用做了哈
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11楼2012-10-08 12:42:25
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shuizhao

木虫 (著名写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by fangang1111 at 2012-10-08 12:42:25
你已经用第一种方法补充做了，那就应该可以了哈，第二种方法就是从新做实验，建立定量方法验证了，工作量有点大，可以不用做了哈...

哦，但是我的原文里面已经有你说的第一种方法了啊，为什么审稿人还要问这个问题呢？好奇怪啊，那我怎么回答呢？是把结果再重申一遍吗？
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加油！奋起的小猪~~
12楼2012-10-08 16:31:58
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lingchaoju

木虫 (小有名气)
我是个外行，但最近要用PLS-DA，PCA之类的分类方法来研究对不同香型物质进行分类指标的筛选，也就是从众多的品质指标中筛选出对不同香型区分具有重要贡献的品质指标，问题是：筛选的标准是什么？我看很多文章比如代谢组学中通过不同物质的NMR化学位移进行分析，然后从载荷图中看那些离原点最远，来作为区分不同组的重要指标。这个筛选化学位移的原则是什么？求教各位老师和虫友！或是有什么相关的书籍可以推荐也不甚感激！
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未雨绸缪，厚积薄发。
13楼2013-01-28 11:36:02
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shuizhao

木虫 (著名写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by lingchaoju at 2013-01-28 11:36:02
我是个外行，但最近要用PLS-DA，PCA之类的分类方法来研究对不同香型物质进行分类指标的筛选，也就是从众多的品质指标中筛选出对不同香型区分具有重要贡献的品质指标，问题是：筛选的标准是什么？我看很多文章比如代 ...

木有做过NMR-based metabolomic,sorry。。。
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加油！奋起的小猪~~
14楼2013-01-28 21:25:34
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辫子人

铜虫 (小有名气)
送红花一朵
你好，这么长时间了，不知楼主还在用SIMCA做代谢组学，请问你的PLS-DA图的Y是怎么设置的呢，这属于分类变量，怎么取值啊？这个不懂，我后面根本做不了啊！
期望您回复，正在写毕业论文，不会统计数据，特别愁啊！
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15楼2013-04-18 18:32:03
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shuizhao

木虫 (著名写手)
引用回帖:
15楼: Originally posted by 辫子人 at 2013-04-18 18:32:03
你好，这么长时间了，不知楼主还在用SIMCA做代谢组学，请问你的PLS-DA图的Y是怎么设置的呢，这属于分类变量，怎么取值啊？这个不懂，我后面根本做不了啊！
期望您回复，正在写毕业论文，不会统计数据，特别愁啊！

我当时设置的图是这样的，我不是很清楚你说的Y是什么，你看这个你有没有用啊

1.jpg
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

辫子人
加油！奋起的小猪~~
16楼2013-04-19 09:36:02
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辫子人

铜虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
16楼: Originally posted by shuizhao at 2013-04-19 09:36:02
我当时设置的图是这样的，我不是很清楚你说的Y是什么，你看这个你有没有用啊

1.jpg
...

两行secondary ID是你自己设置的吗？
我的意思是这样的，你不是有分正常组和模型组吗，做PLS-DA不是要设X变量和Y变量吗？你是怎么对他们定义变量的呢？
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17楼2013-04-19 12:25:03
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guoguo515

木虫 (正式写手)
请问，您的S-plot图是怎么做的呢，一直纠结着，谢谢啦
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18楼2013-06-13 19:06:23
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zw0123456789zw

至尊木虫 (职业作家)

Felix Baumgartner Space Jump
引用回帖:
16楼: Originally posted by shuizhao at 2013-04-19 09:36:02
我当时设置的图是这样的，我不是很清楚你说的Y是什么，你看这个你有没有用啊

1.jpg
...

这是SIMCA-P软件吗？ 是不是Demo版本不能做这方面的分析啊，功能有限制，它的PCA结果准确吗。

NMR代谢组学研究，原始数据如何选择啊？谢谢
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19楼2013-06-13 21:30:52
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fan249205013

新虫 (初入文坛)
送红花一朵
楼主，请问下我在simca-p软件上作PLS模型的预测，为什么删了两组数据后Y Predicted Plot图中的RMSEP值没有结果，而没删之前是有的？
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20楼2013-07-12 10:38:00
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