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lindlar0078木虫 (著名写手)
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单机上（双CPU），Materials Studio 6.0 单核可以计算，但是无法并行计算，啥问题呀
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前两天已经成功安装了Materials Studio 6.0，但是不小心系统崩溃，重新安装系统及编译器后就发现，无法并行计算，但是单核可以计算，一直未找到问题所在，请问如何解决？（把openmpi-1.6.2从换为低版本openmpi-1.6.1也不行） 下面是详细安装过程： 一、安装的系统为 SUSE Linux Enterprise Server 11 SP2 [root]$ zypper install gcc-c++ （解决c++安装时无g++问题 ） 二、安装最新Intel的C++和Fortran编译器 1、c++安装(默认安装在/opt/下) [root]$ tar -zxvf ***** ./install.sh (后面按照提示即可，后面与Fortran一起设置环境变量) 2、Fortran安装(默认安装在/opt/下) [root]$ tar -zxvf ***** ./install.sh 3、环境变量设置 [root]$ vi /etc/profile source /opt/intel/bin/iccvars.sh intel64 source /opt/intel/bin/ifortvars.sh intel64 export MKL_HDME=/opt/intel/mkl export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/intel/mkl/lib/intel64 [root]$ source /etc/profile 三、安装openmpi-1.6.2（先安装为openmpi-1.6.2，后来改为openmpi-1.6.1） [root]$ tar -zxvf ****** [root]$ ./configure --prefix=/opt/openmpi CC=icc CXX=icpc F77=ifort FC=ifort [root]$ make all [root]$ make install [root]$ make clean [root]$ vi /etc/profile export PATH=/opt/openmpi-1.6.1/bin/:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/openmpi-1.6.1/lib [root]$ source /etc/profile 四、安装Materials Studio 6.0 安装补丁: glibc-2.11.1-0.17.4 (32-bit and 64-bit)，libstdc++33-32bit-3.3.3-11.9 1、在msi用户下安装 [msi]$ ./Install 2、导入证书 msi.lic 将msi.lic 复制到 /home/msi/opt/Accelrys/LicensePack/Licenses 3、启动网关 进入/home/msi/opt/Accelrys/MaterialsStudio6.0/etc/Gateway，执行 ./msgateway_control_18888 restart 将Gateway注册为自动启动服务，可执行下面的命令：在root下 cp /home/msi/Accelrys/MaterialsStudio6.0/etc/Gateway/msgateway_control_18888 /etc/init.d/msgateway_control_18888 chkconfig --add msgateway_control_18888 4、设置环境变量 [msi]$ vi ~/.bashrc export MS_INSTALL_ROOT=/home/msi/opt/Accelrys/MaterialsStudio6.0 export DMOL3_DATA=$MS_INSTALL_ROOT/share/Resources/Quantum/DMol3 export DMOL_TMP=~/scratch export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/msi/opt/Accelrys/LicensePack/linux/lib/ export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$MS_INSTALL_ROOT/lib export TMPDIR=$DMOL_TMP export PATH=$PATH:$MS_INSTALL_ROOT/etc/CASTEP/bin . /home/msi/opt/Accelrys/LicensePack/etc/lp_profile eval `$MS_INSTALL_ROOT/share/license/data/lic_setup.sh $MS_INSTALL_ROOT/ -s sh` [msi]$ source ~/.bashrc 经过测试，在工作目录下[msi]$ RunCASTEP.sh filename正常，但是RunCASTEP.sh -np -12 filename 无法运行 |
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lindlar0078
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