| 查看: 1544 | 回复: 2 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
lindlar0078木虫 (著名写手)
|
[求助]
单机上（双CPU），Materials Studio 6.0 单核可以计算，但是无法并行计算，啥问题呀
|
||
|
前两天已经成功安装了Materials Studio 6.0，但是不小心系统崩溃，重新安装系统及编译器后就发现，无法并行计算，但是单核可以计算，一直未找到问题所在，请问如何解决？（把openmpi-1.6.2从换为低版本openmpi-1.6.1也不行） 下面是详细安装过程： 一、安装的系统为 SUSE Linux Enterprise Server 11 SP2 [root]$ zypper install gcc-c++ （解决c++安装时无g++问题 ） 二、安装最新Intel的C++和Fortran编译器 1、c++安装(默认安装在/opt/下) [root]$ tar -zxvf ***** ./install.sh (后面按照提示即可，后面与Fortran一起设置环境变量) 2、Fortran安装(默认安装在/opt/下) [root]$ tar -zxvf ***** ./install.sh 3、环境变量设置 [root]$ vi /etc/profile source /opt/intel/bin/iccvars.sh intel64 source /opt/intel/bin/ifortvars.sh intel64 export MKL_HDME=/opt/intel/mkl export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/intel/mkl/lib/intel64 [root]$ source /etc/profile 三、安装openmpi-1.6.2（先安装为openmpi-1.6.2，后来改为openmpi-1.6.1） [root]$ tar -zxvf ****** [root]$ ./configure --prefix=/opt/openmpi CC=icc CXX=icpc F77=ifort FC=ifort [root]$ make all [root]$ make install [root]$ make clean [root]$ vi /etc/profile export PATH=/opt/openmpi-1.6.1/bin/:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/opt/openmpi-1.6.1/lib [root]$ source /etc/profile 四、安装Materials Studio 6.0 安装补丁: glibc-2.11.1-0.17.4 (32-bit and 64-bit)，libstdc++33-32bit-3.3.3-11.9 1、在msi用户下安装 [msi]$ ./Install 2、导入证书 msi.lic 将msi.lic 复制到 /home/msi/opt/Accelrys/LicensePack/Licenses 3、启动网关 进入/home/msi/opt/Accelrys/MaterialsStudio6.0/etc/Gateway，执行 ./msgateway_control_18888 restart 将Gateway注册为自动启动服务，可执行下面的命令：在root下 cp /home/msi/Accelrys/MaterialsStudio6.0/etc/Gateway/msgateway_control_18888 /etc/init.d/msgateway_control_18888 chkconfig --add msgateway_control_18888 4、设置环境变量 [msi]$ vi ~/.bashrc export MS_INSTALL_ROOT=/home/msi/opt/Accelrys/MaterialsStudio6.0 export DMOL3_DATA=$MS_INSTALL_ROOT/share/Resources/Quantum/DMol3 export DMOL_TMP=~/scratch export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/msi/opt/Accelrys/LicensePack/linux/lib/ export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$MS_INSTALL_ROOT/lib export TMPDIR=$DMOL_TMP export PATH=$PATH:$MS_INSTALL_ROOT/etc/CASTEP/bin . /home/msi/opt/Accelrys/LicensePack/etc/lp_profile eval `$MS_INSTALL_ROOT/share/license/data/lic_setup.sh $MS_INSTALL_ROOT/ -s sh` [msi]$ source ~/.bashrc 经过测试，在工作目录下[msi]$ RunCASTEP.sh filename正常，但是RunCASTEP.sh -np -12 filename 无法运行 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 计算MS等 |
» 猜你喜欢
基金啊基金
已经有3人回复
-
科研孤儿太难了
已经有15人回复
-
让我中一个面上吧！
已经有10人回复
-
言之凿凿，明天官网会通知放榜？
已经有17人回复
-
时间戳又变了
已经有17人回复
-
今天系统多次维护，明天很可能放榜！
已经有11人回复
-
时间戳变了，能看出什么问题？
已经有23人回复
-
只有每年这种时候来逛逛小木虫
已经有22人回复
-
放榜前的不淡定
已经有12人回复
-
重要消息，中午系统在维护
已经有12人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Materials Studio 6.0 在单机上的安装与测试
已经有11人回复
- Materials studio多核计算不能进行
已经有4人回复
- fluent 单机并行计算出错
已经有5人回复
- intel visual fortran 多核并行计算
已经有14人回复
- 【求助】单机多核fluent并行udf
已经有13人回复
- 【求助】关于fluent单机并行计算的设置
已经有9人回复
- 【求助】单机多核UDF怎么并行计算
已经有15人回复
- 【求助】单机四核并行效率怎么这么低？
已经有11人回复
- 【原创】vasp单机双核计算流程
已经有8人回复
- 【求助】CASTEP单机多核并行计算问题
已经有19人回复
lindlar0078
木虫 (著名写手)
- 应助: 20 (小学生)
- 金币: 2529.5
- 散金: 1
- 红花: 6
- 帖子: 1540
- 在线: 698.9小时
- 虫号: 277938
- 注册: 2006-09-09
- 专业: 无机材料化学
3楼2012-10-01 19:03:40
漂泊四方
金虫 (小有名气)
- 1ST强帖: 2
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 1321.2
- 散金: 50
- 红花: 6
- 帖子: 198
- 在线: 115.2小时
- 虫号: 897145
- 注册: 2009-11-08
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
2楼2012-10-01 15:28:24
