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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Siesta&Smeagol&Atk » siesta能像vasp一样对于优化后的结构进行振动频率分析吗？
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yangzhaodi1978

木虫 (小有名气)

[交流] siesta能像vasp一样对于优化后的结构进行振动频率分析吗？

各位高手，想请教一下，用siesta优化完的结构，怎么知道是不是稳定构型，是不是能量极小值点。在siesta中没有像vasp一样的可以进行振动频率分析的计算？
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1楼 2012-09-29 00:46:32
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huangll99

木虫 (职业作家)
★
yangzhaodi1978(金币+1): 谢谢参与
送鲜花一朵
VASP是怎么做的？？？
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2楼2012-09-29 09:42:31
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tic2009

金虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★
yangzhaodi1978(金币+1): 谢谢参与
yangzhaodi1978: 金币+3, 优秀 2012-10-01 03:01:33
可以，利用优化好结构计算声子谱图 (SIESTA/Util/Vibra/vibrator)
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3楼2012-09-30 11:44:31
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yangzhaodi1978

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by tic2009 at 2012-09-30 11:44:31
可以，利用优化好结构计算声子谱图 (SIESTA/Util/Vibra/vibrator)

哈哈，谢谢您，我是初学者，能说的详细些吗？具体的命令是vibra吗？
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4楼2012-10-01 03:02:53
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tic2009

金虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
分子的振动谱(IR, Raman)可以通过计算Γ-点声子谱获得，除了SIESTA主程序外还需要另外两个工具程序：fcbuild和vibrator，前者用于构建超胞（计算力常数的输入文件）后者用于对角化力常数矩阵，获得声子谱，其中力常数矩阵的计算仍然由siesta完成，这一步很耗时，并且对结构优化精度要求较高，否则会有非物理的虚频出现。
具体细节请参见 /SIESTA/Util/Vibra/Docs中的说明文件，工具程序在/SIESTA/Util/Vibra/Src文件夹中，编译前最好将vibra.h中的参数maxa（maximum number of atoms in the unit cell）设置大一些，至少大于你所计算的体系中原子个数。
祝你成功。
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5楼2012-10-01 14:19:49
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冰冰旺旺

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主,您好,我也是siesta的初学者,现在有由CP2K优化好的分子结构,要计算其振动谱,得到振动频率,看到您上面的提问,现在问题应该都解决了吧,可不可以赐教赐教,不胜感激
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6楼2014-04-09 15:04:49
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