24小时热门版块排行榜    

查看: 2377  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

yangzhaodi1978

木虫 (小有名气)


[交流] siesta能像vasp一样对于优化后的结构进行振动频率分析吗?

各位高手,想请教一下,用siesta优化完的结构,怎么知道是不是稳定构型,是不是能量极小值点。在siesta中没有像vasp一样的可以进行振动频率分析的计算?
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

第一性原理相关文档

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangzhaodi1978

木虫 (小有名气)


引用回帖:
3楼: Originally posted by tic2009 at 2012-09-30 11:44:31
可以,利用优化好结构计算声子谱图 (SIESTA/Util/Vibra/vibrator)

哈哈,谢谢您,我是初学者,能说的详细些吗?具体的命令是vibra吗?
4楼2012-10-01 03:02:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

huangll99

木虫 (职业作家)



yangzhaodi1978(金币+1): 谢谢参与
送鲜花一朵
VASP是怎么做的???
2楼2012-09-29 09:42:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tic2009

金虫 (初入文坛)


★ ★ ★ ★
yangzhaodi1978(金币+1): 谢谢参与
yangzhaodi1978: 金币+3, 优秀 2012-10-01 03:01:33
可以,利用优化好结构计算声子谱图 (SIESTA/Util/Vibra/vibrator)
3楼2012-09-30 11:44:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tic2009

金虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
分子的振动谱(IR, Raman)可以通过计算Γ-点声子谱获得,除了SIESTA主程序外还需要另外两个工具程序:fcbuild和vibrator,前者用于构建超胞(计算力常数的输入文件)后者用于对角化力常数矩阵,获得声子谱,其中力常数矩阵的计算仍然由siesta完成,这一步很耗时,并且对结构优化精度要求较高,否则会有非物理的虚频出现。
具体细节请参见 /SIESTA/Util/Vibra/Docs中的说明文件,工具程序在/SIESTA/Util/Vibra/Src文件夹中,编译前最好将vibra.h中的参数maxa(maximum number of atoms in the unit cell)设置大一些,至少大于你所计算的体系中原子个数。
祝你成功。
5楼2012-10-01 14:19:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题,而不是去凝练问题 +5 瞬息宇宙 2026-09-01 11/550 2026-09-02 14:15 by simwe390
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +5 瞬息宇宙 2026-08-31 5/250 2026-09-02 10:13 by 雨冰共舞
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 8/400 2026-09-02 02:42 by Leogzhya
[基金申请] 面上合作单位盖章 +6 ssyjh 2026-08-27 9/450 2026-09-01 20:01 by huagongfeihu
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +13 Kittylucky 2026-08-27 14/700 2026-09-01 11:06 by feng6531
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
信息提示
请填处理意见