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rain841230

捐助贵宾 (正式写手)

[求助] Bad AFIX connectivity

给N理论加氢，用的HFIX 23, 但是显示Bad AFIX connectivity：N1 bonds to .... 的错误信息，应该指的是shelx找到N的成键情况后觉得N的杂化的情况订错了，无法加氢，这应该如何解决？
TITL P21_c in P2(1)/c
CELL 0.71073   7.4654   7.0068  13.2759  90.000 106.069  90.000
ZERR    4.00   0.0015   0.0014   0.0027   0.000   0.030   0.000
LATT  1
SYMM -X, 0.5+Y, 0.5-Z
SFAC N H K ZN
UNIT 16 32 8 4

L.S. 4
BOND
FMAP 2
PLAN 20
HFIX 23 N1

WGHT    0.034900
EXTI    0.014163
FVAR       0.23173
ZN1   4    0.704088    0.214322    0.151715    11.00000    0.03067    0.02981 =
         0.02175    0.00159    0.00683    0.00012
K2    3    0.572693    0.138397    0.392960    11.00000    0.03776    0.05024 =
         0.03038   -0.00378    0.00951   -0.00568
K3    3    1.077850    0.151499    0.398792    11.00000    0.03898    0.05127 =
         0.03868   -0.00518    0.01178    0.00349
N1    1    0.433756    0.230704    0.059665    11.00000    0.03232
N2    1    0.878672    0.235413    0.056198    11.00000    0.03140
N3    1    0.749061    0.453032    0.243475    11.00000    0.04110
N4    1    0.753473   -0.017816    0.244996    11.00000    0.04301
HKLF 4

REM  P21_c in P2(1)/c
REM R1 =  0.0376 for   1248 Fo > 4sig(Fo)  and  0.0592 for all   1792 data
REM     45 parameters refined using      0 restraints

END  
     
WGHT      0.0669      0.0000
REM Highest difference peak  0.777,  deepest hole -0.550,  1-sigma level  0.144
Q1    1   0.7651  0.3832  0.2755  11.00000  0.05    0.78
Q2    1   0.7269 -0.0770  0.2040  11.00000  0.05    0.75
Q3    1   0.8951  0.2845  0.0528  11.00000  0.05    0.74
Q4    1   0.8813  0.1402  0.0187  11.00000  0.05    0.73
Q5    1   0.7804  0.0109  0.2644  11.00000  0.05    0.71
Q6    1   0.9946  0.2179  0.0982  11.00000  0.05    0.69
Q7    1   0.8738  0.4772  0.2786  11.00000  0.05    0.67
Q8    1   0.7253  0.4899  0.2202  11.00000  0.05    0.64
Q9    1   0.3691  0.2180  0.0999  11.00000  0.05    0.62
Q10   1   0.6949  0.4807  0.3006  11.00000  0.05    0.61
Q11   1   0.4333  0.1530  0.0351  11.00000  0.05    0.57
Q12   1   0.8660 -0.0860  0.2561  11.00000  0.05    0.56
Q13   1   0.2046  0.1977  0.1397  11.00000  0.05    0.39
Q14   1   1.1560  0.2464  0.1428  11.00000  0.05    0.39
Q15   1   1.0257  0.1250  0.3052  11.00000  0.05    0.37
Q16   1   1.0237  0.1091  0.3840  11.00000  0.05    0.36
Q17   1   0.7996  0.5699  0.3384  11.00000  0.05    0.32
Q18   1   0.5514  0.1004  0.3621  11.00000  0.05    0.32
Q19   1   0.5474  0.2861  0.3057  11.00000  0.05    0.31
Q20   1   0.8421  0.1053 -0.0641  11.00000  0.05    0.30
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1楼 2012-09-28 23:35:58
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luxtal

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
linhua0402313: 金币+1, 恩，感谢回帖交流，希望对楼主有帮助 2012-09-29 08:12:29
删除ins文件里HFIX 23 N1这一行，然后xl精修，再换别的加氢方式试试。
赞一下 回复此楼
What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg
2楼2012-09-28 23:59:58
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rain841230

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by luxtal at 2012-09-28 16:59:58
删除ins文件里HFIX 23 N1这一行，然后xl精修，再换别的加氢方式试试。

也就是说无法理论加氢吗？？
赞一下 回复此楼
3楼2012-09-30 19:07:53
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
KILL $H
然后精修
然后再次理论加H
应该就OK了吧？
赞一下 回复此楼
4楼2012-09-30 19:43:52
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rain841230

捐助贵宾 (正式写手)
还是没有成功，可能Hfix指令没法给端基上的NH2加氢吧
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5楼2012-10-19 22:27:22
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