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zhangsdtz金虫 (小有名气)
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[求助]
VMD如何利用.xyz文件计算g(r)?
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VMD导入.xyz 文件后，Extensions-Analysis-Radial pair distribution function后无法计算，出现如下错误： “There was an error creating the selections: atomselect: cannot parse selections text.” 是什么原因？ 另外，如何xyz文件转化为ＰＤＢ文件？（我是初学者，不太懂ＶＭＤ） |
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zhangsdtz: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 多谢您的回答。 2012-09-29 08:33:27
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关于计算你可以看看这里http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/plugins/gofrgui/ 第二个问题“如何xyz文件转化为ＰＤＢ文件？” 你是初学者，建议你去看看VMD的手册，VMD是免费的软件。 具体方法， 一种：你可以把xyz文件导入到VMD之中，然后保存成PDB 格式就行了。 步骤如下：   第二种：使用命令 这两个命令很简单，看懂这两个命令的具体意思，作为你学习VMD的开始吧。 VMD 的所有操作都可以使用命令来实现。 set all [atomselect top all] $all writepdb sio2.pdb  [ Last edited by jiaoyixiong on 2012-9-28 at 22:18 ] |
2楼2012-09-28 22:15:29