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laomian006

木虫 (小有名气)

[求助] 用NAMD模拟聚合物与微生物膜相互中用

做聚合物(壳聚糖)与微生物生物膜(微生物膜主要由磷脂双层膜和脂多糖构成)相互作用动力学。

我们知道蛋白质分子和DNA分子的pdb文件都可以从数据库下载。

在VMD插件中可以自动生成磷脂双层膜,

但是壳聚糖和脂多糖这两种中等程度的大分子,没法生成。我尝试用VMD中的插件Molefacture来生成分子,发现实在不方便,请问您能够有什么好的方法,可以生成非蛋白质和非DNA的大分子。
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心出发

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-06 19:15:58
你有没有试过用chemoffice生成结构
2楼2012-10-06 18:58:39
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