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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Abinit » ABINIT的并行效率着实不高
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Toapollo

铁杆木虫 (正式写手)

西部牛仔

[交流] ABINIT的并行效率着实不高 已有4人参与

由于用ABINIT运行大型的优化和介电计算耗时许久也没有完成，一时兴起做了一下简单串行和并行运算的对比，才恍然大悟：
单核心 FCC 4+2Al层结构优化和能量计算 耗时约658s；
6核心  结构同上 耗时约318， 总cup耗时1907s  ；
可见，并行每增加一核心效率才提升了只有约20%！！！
怎么回事呀，难怪大型计算是如此的慢。而CASTEP的并行效率的提升可以达到60~80%每核心。
所以个人感觉ABINIT并行伤不起呀，计算时主频远比核心重要得多了~
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偷得一日闲便是福，枉作千年计岂非愚！
1楼 2012-09-22 07:02:44
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wzbhit

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
VASP计算时也是主频要比核数重要的多~~~
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从明天开始坚持吃早饭呀！
2楼2012-09-22 09:07:28
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tangosnow

木虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
http://arxiv.org/abs/0707.3405
可以参考下这篇文章
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

Toapollo
3楼2012-12-01 05:22:56
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Toapollo

铁杆木虫 (正式写手)

西部牛仔
送鲜花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by tangosnow at 2012-12-01 05:22:56
http://arxiv.org/abs/0707.3405
可以参考下这篇文章

受教了，谢谢~
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偷得一日闲便是福，枉作千年计岂非愚！
4楼2012-12-02 00:06:51
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goldenfisher

金虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
ABINIT在SCF方面确实很费劲。此外，其K点并行为主，cpu数目超过K点数目为浪费的。
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5楼2012-12-02 23:07:20
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souledge

专家顾问 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
就算不是并行，SCF的收敛，尤其是结构优化时的stress收敛，在Abinit中都是漫长痛苦的过程～
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思想重于技巧，内涵重于表象
6楼2012-12-03 08:00:55
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tangosnow

木虫 (小有名气)
★
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引用回帖:
6楼: Originally posted by souledge at 2012-12-03 08:00:55
就算不是并行，SCF的收敛，尤其是结构优化时的stress收敛，在Abinit中都是漫长痛苦的过程～

你用ionmov=2还是3？
教程上都是BFGS，但是我发现在实际中，区别很大，其中一个要等很久，另外一个很快，我一直没明白。例子里好像一般是给出ionmov=3.。。
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7楼2012-12-07 05:21:14
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