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有人用RNA-seq的数据计算polyA位点的使用 RUD得分么
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今夜无风
新虫
(初入文坛)
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(幼儿园)
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帖子: 5
在线: 1.1小时
虫号: 792186
[交流]
有人用RNA-seq的数据计算polyA位点的使用 RUD得分么
如题,根据RNA-seq的数据,通过计算polyA位点下游reads的密度与上游reads密度的比(RUD)来看polyA位点的使用情况,现在计算的结果出现了很多RUD>1的情况,感觉上游的reads至少和下游的reads差不多,不知道对于大于1的情况怎么解释,希望大侠帮帮忙!!
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1楼
2012-09-20 16:48:21
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今夜无风
铜虫
(小有名气)
应助: 0
(幼儿园)
金币: 357.6
帖子: 86
在线: 16.4小时
虫号: 1203752
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
没有人做这方面的么?有没有相应的软件可以得到?
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3楼
2012-09-25 15:23:09
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yyk81
木虫
(正式写手)
应助: 14
(小学生)
金币: 4072.9
帖子: 936
在线: 45.4小时
虫号: 1387477
帮顶!
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼
2012-09-21 07:17:01
已阅
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