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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 有人用RNA-seq的数据计算polyA位点的使用 RUD得分么
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今夜无风

新虫 (初入文坛)

[交流] 有人用RNA-seq的数据计算polyA位点的使用 RUD得分么

如题，根据RNA-seq的数据，通过计算polyA位点下游reads的密度与上游reads密度的比(RUD)来看polyA位点的使用情况，现在计算的结果出现了很多RUD>1的情况，感觉上游的reads至少和下游的reads差不多，不知道对于大于1的情况怎么解释，希望大侠帮帮忙！！
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1楼 2012-09-20 16:48:21
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yyk81

木虫 (正式写手)
帮顶!

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼2012-09-21 07:17:01
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今夜无风

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
没有人做这方面的么？有没有相应的软件可以得到？
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3楼2012-09-25 15:23:09
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