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落枫4161296

铁虫 (小有名气)

[求助] 氨基酸和混合溶剂形成的氢键问题

用高斯计算,是计算溶剂模型还是溶剂效应
酪氨酸(还有色氨酸)  和水以及异丙醇的混合溶剂形成的氢键怎么算,我要看酪氨酸和混合溶剂形成的氢键。还有酪氨酸和单个溶剂形成的氢键又怎么算

万分感谢,等待急用
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gujing136

禁虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 落枫4161296 at 2012-09-21 15:16:10
是用高斯算吗,关键字是什么...

是啊,你去网上找一下BSSE就好了,很多的··
叫老猫的兔子
4楼2012-09-21 15:52:38
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gujing136

禁虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
落枫4161296: 金币+1, 有帮助 2012-09-24 15:27:01
算个BSSE就可以得出氢键的能量了,不知道你是不是想这样算··
叫老猫的兔子
2楼2012-09-20 18:32:11
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落枫4161296

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gujing136 at 2012-09-20 18:32:11
算个BSSE就可以得出氢键的能量了,不知道你是不是想这样算··

是用高斯算吗,关键字是什么
3楼2012-09-21 15:16:10
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vigaryang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2012-09-22 10:46:24
落枫4161296: 金币+2, 有帮助, 谢谢 2012-09-24 15:26:46
对于混合溶剂的氢键,如果用Gaussian算的话,如何构建溶质周围的溶剂化层(即如何确定水分子和异丙醇分子的个数和位置)将是一大问题。对于这种情况,不如使用分子动力学模拟进行计算,通过径向分布函数可以获得氢键作用的位点、个数、强度等信息。
5楼2012-09-21 23:04:14
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