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碳纳米管设成rigid
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研究CNT在Ar剪切流体中的运动情况，希望时间步长能够取大一点儿，这样计算的快一些，因此考虑将CNT设成刚体，用fix rigid，但是Ar原子出现了lost atoms，程序关键部分如下： fix 6 cnt rigid single compute mobile ar temp/partial 1 0 1 （计算ar的温度，流动方向y的速度不算） velocity ar create 300.0 341233 temp mobile fix 1 nrigid nve （nrigid代表不是CNT的流体部分，用NVE） fix 2 ar temp/rescale 100 300.0 300.0 5.0 1.0 fix_modify 2 temp mobile 另外： neighbor 2.0 bin neigh_modify delay 5 exclude group cnt cnt timestep 0.01 （10fs，这个时间对于纯Ar流体的计算是合理的） 原本考虑C-C键相互作用时timestep是0.001（1fs），没问题，现在CNT是刚体时设成0.001也行，但是增大就不行了，另外这个neighbor怎么设我也不太清楚 小弟求各位大牛帮忙！！！！ |
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