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匿名

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wenwen4599

金虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 周游1166 at 2012-09-17 21:23:19
那问题是,有几篇文章他们是把真菌的18S与28S的序列连在一起搞一个发育树,这个是怎么办到的呢?...

18S和28S分别比对,用一些剪切软件,比如gblock,将简约信息位点剪下后,将得到的两个数据集进行连接。貌似是用paup评估两部分的一致性,如果一致性好的话就可以直接用这个合并的数据集构树了。
9楼2012-11-07 15:46:01
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江南流觞

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个得看情况,我们实验室在金斯瑞测序鉴定的话就有不同的结果,28S,ITS都有,我们是拿来就用的。至于你的情况的话,你可以去看看与你课题相关的文献,指不定有点思路。祝福你了!

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

为了未来奋斗吧
2楼2012-09-17 16:07:21
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匿名

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3楼2012-09-17 16:49:46
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江南流觞

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 周游1166 at 2012-09-17 16:49:46
那就是说,不能依靠序列来鉴定哇?...

也不是,各种菌的鉴定序列或许不一样,具体参照标准的话我也不是很清楚,在等高手回复吧。
为了未来奋斗吧
4楼2012-09-17 18:23:06
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