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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » ADF/Dalton » 求linux版2012的ADF安装教程
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wozecheng

金虫 (小有名气)

[求助] 求linux版2012的ADF安装教程

看着安装手册依然无法下手，求指导，谢谢各位了
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1楼 2012-09-12 17:02:00
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2012-09-14 14:34:34
wozecheng: 金币+3, ★★★很有帮助, 金币不多谢谢啦 2012-09-14 19:52:18
wozecheng: 金币+5 2012-09-17 20:17:44
wozecheng: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2012-10-12 10:08:14
这个很简单，解压，设置环境变量即可。
具体的操作：
进入你想安装的目录，比如/opt：
cd /opt
tar zxvf /root/adf2012.01a.pc64_linux.platform_mpi.bin.tgz (这一步解压，并假设该文件在/root目录下）
解压完成后，将license文件拷贝到/opt/adf2012.01目录下，并修改/opt/adf2012.01目录下的adfrc.sh文件，将其中的ADFHOME设置为你的安装目录，此处为：
ADFHOME=/opt/adf2012.01

最后，在你的~/.bashrc里面加入一句：
source /opt/adf2012.1/adfrc.sh
保存退出，然后source ~/.bashrc即可。
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2楼2012-09-14 12:43:32
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普通回帖

wozecheng

金虫 (小有名气)
装了一天，依然没成功。
安装上面方法出现:/opt/adf2012.21/adfrc.sh:没有权限。
在adfrc.sh中只是改ADFHOME=/opt/adf2012.01这一处吗？
我看adf的安装手册，也很难看懂，好像方法差别很大啊？
我验证license时，说no license file found, set the scmlicense environment variable。可我已经把license放到adf2012.01里了啊？
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3楼2012-09-15 19:44:24
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wozecheng

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by pwzhou at 2012-09-14 12:43:32
这个很简单，解压，设置环境变量即可。
具体的操作：
进入你想安装的目录，比如/opt：
cd /opt
tar zxvf /root/adf2012.01a.pc64_linux.platform_mpi.bin.tgz (这一步解压，并假设该文件在/root目录下）
解压完 ...

装了一天，依然没成功。
安装上面方法出现:/opt/adf2012.21/adfrc.sh:没有权限。
在adfrc.sh中只是改ADFHOME=/opt/adf2012.01这一处吗？
我看adf的安装手册，也很难看懂，好像方法差别很大啊？
我验证license时，说no license file found, set the scmlicense environment variable。可我已经把license放到adf2012.01里了啊？
求解答
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4楼2012-09-15 19:45:05
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

这个是权限问题导致的，正常不该出现这个问题的。难道你是从windows下解压然后传上去的，如果是的话，那就在linux直接解压。
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5楼2012-09-17 21:03:56
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wozecheng

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by pwzhou at 2012-09-17 21:03:56
这个是权限问题导致的，正常不该出现这个问题的。难道你是从windows下解压然后传上去的，如果是的话，那就在linux直接解压。

我用linux解压的adf2012.01a.pc64_linux.platform_mpi.bin.tgz，license直接下载就是license.txt，然后复制到adf2012.01里面。后来设置了环境变量后，依然不能跑。出现的错误我上传一下，我先验证license，再跑结果就报错。
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6楼2012-09-18 09:51:09
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wozecheng

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by pwzhou at 2012-09-17 21:03:56
这个是权限问题导致的，正常不该出现这个问题的。难道你是从windows下解压然后传上去的，如果是的话，那就在linux直接解压。

这是linux的显示。
[root@localhost ~]# /opt/adf2012.01/bin/dirac check

Checked: /opt/adf2012.01/license

License termination date (mm/dd/yyyy): 10/11/2012

According to it, you are allowed to run:

           ADF version  2012.99
        ADFGUI version  2012.99
           GUI version  2012.99
     REAXFFGUI version  2012.99
          BAND version  2012.99
       BANDGUI version  2012.99
           CRS version  2012.99
          DFTB version  2012.99
       DFTBGUI version  2012.99
         MOPAC version  2012.99
        REAXFF version  2012.99
         Utils version  2012.99

Number of procs you are allowed to use for:

ADF    :       8 procs
BAND   :       8 procs
DFTB   :       8 procs
ReaxFF :       8 procs

=====================================================
release: 2012.01
:----------:
:Linuxlocalhost.localdomain1C:6F:65:FE:E7:A8:
ncores :           6
=====================================================
LICENSE INFO READY
[root@localhost ~]# /opt/adf2012.01/bin/dirac check

Checked: /opt/adf2012.01/license

License termination date (mm/dd/yyyy): 10/11/2012

According to it, you are allowed to run:

           ADF version  2012.99
        ADFGUI version  2012.99
           GUI version  2012.99
     REAXFFGUI version  2012.99
          BAND version  2012.99
       BANDGUI version  2012.99
           CRS version  2012.99
          DFTB version  2012.99
       DFTBGUI version  2012.99
         MOPAC version  2012.99
        REAXFF version  2012.99
         Utils version  2012.99

Number of procs you are allowed to use for:

ADF    :       8 procs
BAND   :       8 procs
DFTB   :       8 procs
ReaxFF :       8 procs

=====================================================
release: 2012.01
:----------:
:Linuxlocalhost.localdomain1C:6F:65:FE:E7:A8:
ncores :           6
=====================================================
LICENSE INFO READY
[root@localhost ~]# $ADFBIN/adf out
LICENSE INVALID
LICENSE INVALID
MPI Application rank 6 exited before MPI_Finalize() with status 0
forrtl: error (78): process killed (SIGTERM)
Image              PC                Routine            Line        Source            
libpthread.so.0    0000003D97E0D8E0  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000184BC62  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012F2BFB  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012EC160  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412BF7  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: error (78): process killed (SIGTERM)
Image              PC                Routine            Line        Source            
libpthread.so.0    0000003D97E0D8E0  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041260E  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041254C  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003D9721D994  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412459  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: error (78): process killed (SIGTERM)
Image              PC                Routine            Line        Source            
libpthread.so.0    0000003D97E0D860  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027C5842  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027C6806  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027FA55F  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027F6078  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012EB68F  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000184BC62  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012F4BC7  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012EC160  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412BF7  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041260E  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041254C  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003D9721D994  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412459  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: error (78): process killed (SIGTERM)
Image              PC                Routine            Line        Source            
libpthread.so.0    0000003D97E0D860  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027C5842  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027C6806  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027F8674  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012E9700  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012EF22A  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412BF7  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041260E  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041254C  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003D9721D994  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412459  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: error (78): process killed (SIGTERM)
forrtl: error (78): process killed (SIGTERM)
Image              PC                Routine            Line        Source            
libpthread.so.0    0000003D97E0D8E0  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000184BC62  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012F2BFB  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: error (78): process killed (SIGTERM)
Image              PC                Routine            Line        Source            
libpthread.so.0    0000003D97E0D860  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: error (78): process killed (SIGTERM)
Image              PC                Routine            Line        Source            
libpthread.so.0    0000003D97E0D860  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027C5842  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027C6806  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027FA55F  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027F6078  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012EB68F  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012EF22A  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412BF7  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041260E  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041254C  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003D9721D994  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412459  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: error (78): process killed (SIGTERM)
Image              PC                Routine            Line        Source            
libpthread.so.0    0000003D97E0D8E0  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000184BC62  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012F4BC7  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012EC160  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412BF7  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041260E  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041254C  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003D9721D994  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412459  Unknown               Unknown  Unknown
Image              PC                Routine            Line        Source            
libpthread.so.0    0000003D97E0D8E0  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000184BC62  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012F2BFB  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012EC160  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412BF7  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041260E  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041254C  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003D9721D994  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412459  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: error (78): process killed (SIGTERM)
Image              PC                Routine            Line        Source            
libpthread.so.0    0000003D97E0D860  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027C5842  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027C6806  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027F4883  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012E93E4  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012EF22A  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: error (78): process killed (SIGTERM)
Image              PC                Routine            Line        Source            
libpthread.so.0    0000003D97E0D860  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027C5842  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027C6806  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027FA55F  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027F6078  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012EB599  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012EF22A  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412BF7  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041260E  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041254C  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003D9721D994  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412459  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012EF22A  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412BF7  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041260E  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041254C  Unknown               Unknown  Unknown
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adf.exe            000000000041254C  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003D9721D994  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412459  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027C5842  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: error (78): process killed (SIGTERM)
Image              PC                Routine            Line        Source            
libpthread.so.0    0000003D97E0D8E0  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000184BC62  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012F2BFB  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012EC160  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412BF7  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041260E  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041254C  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003D9721D994  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412459  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027C6806  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027FA55F  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000027F6078  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012E9047  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012EF22A  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412BF7  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041260E  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041254C  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003D9721D994  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412459  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: error (78): process killed (SIGTERM)
Image              PC                Routine            Line        Source            
libpthread.so.0    0000003D97E0D8E0  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000184BC62  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012F2BFB  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012EC160  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412BF7  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041260E  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041254C  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003D9721D994  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412459  Unknown               Unknown  Unknown
forrtl: error (78): process killed (SIGTERM)
Image              PC                Routine            Line        Source            
libpthread.so.0    0000003D97E0D8E0  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000184BC62  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012F2BFB  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            00000000012EC160  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412BF7  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041260E  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041254C  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003D9721D994  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412459  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412BF7  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041260E  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            000000000041254C  Unknown               Unknown  Unknown
libc.so.6          0000003D9721D994  Unknown               Unknown  Unknown
adf.exe            0000000000412459  Unknown               Unknown  Unknown
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7楼2012-09-18 09:51:57
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pwzhou

铁杆木虫 (正式写手)
你是不是用了license中未授权的功能啊？
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8楼2012-09-18 11:10:08
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wozecheng

金虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by pwzhou at 2012-09-18 11:10:08
你是不是用了license中未授权的功能啊？

大部分功能都授权了，我觉得是没安装好吧，唉、、、、、
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9楼2012-09-18 15:07:18
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wozecheng

金虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by pwzhou at 2012-09-18 11:10:08
你是不是用了license中未授权的功能啊？

我没有下载adf2012.01.src.tgz，但是要下载 Source code (v2012.01a)，貌似还要另外申请啊？这个如何申呢？？
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10楼2012-09-21 19:12:37
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