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xiaohaiyu

金虫 (正式写手)

[求助] SSR 条带

做SSR时，不出带的原因是什么？同时做了几对引物，别的引物都有清晰的条带，只有两对引物一点条带的迹象都没有，引物都是在同一家公司同一批次合成的，用别的公司合成的，也是做不出带，丙烯酰胺胶也没有问题，marker很清楚，同一块胶点的其他引物条带也很清楚，扩增程序是数据库里提供的，所有的引物都是这样扩增的，就是这两对不出带。其他的体系的试剂都是一样的。
实在是不知道是怎么回事，更改退火温度，做了3、4次都是没有带。
大家的都有什么经验，给个帮助，谢谢啦！
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1楼 2012-09-12 11:33:52
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wu_shiyong

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-09-12 16:05:18
xiaohaiyu: 金币+1, ★有帮助, 但是这两对引物以前做的时候有带呢，并且还挺好的。 2012-09-13 15:53:50
这个没有什么经验不经验，不出来就是不出来，没有什么问题，这两对引物不用了就是！SSR是在很多引物你面筛选的，并不是所有的引物都能扩出来东西！
个人认为这样的引物所扩的重复片段在你的群体里面根本就没有。另外设计这引物时只是找的同源的物种序列设的并不是本种物种，扩不出来也正常！
赞一下 回复此楼
低调稳重务实内敛---------------残
2楼2012-09-12 12:39:09
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