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oneil

金虫 (正式写手)

[求助] 求助高斯计算后处理的一个细节问题

大家好,在这里提一个高斯计算的细节问题,恳请细心指教:
            配合物使用linux计算,优化完成后,导出其fchk文件,然后windows界面下用gaussianview查看其优化后的结构,以及用Gaussianview工具栏上的Mos查看HOMO及LUMO轨道,现在的问题是,结构优化完成后,金属与配体的键在gaussianview上不显示,虽然对结果没影响,但是显示HOMO,LUMO轨道时,键也是没有的,这样在作报告写论文的时候,就很难看了。我尝试将这个键补上,但是补上后,MOS就出不来了,可能认为是一个新的结构,所以无法查看了。所以请教大家,怎么才能不影响计算结果的情况下将键显示出来,谢谢了!
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liucg407

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这有何难,你打开结果文件,把它存成一个新的输入文件。
接下来想怎么编辑都行了,你应该会做了吧。
2楼2012-09-10 11:01:02
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飞行鸟

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
对,楼上说的很对,复制编辑成新的文件。就可以了。
快乐吧
3楼2012-09-11 08:40:44
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oneil

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by liucg407 at 2012-09-10 11:01:02
这有何难,你打开结果文件,把它存成一个新的输入文件。
接下来想怎么编辑都行了,你应该会做了吧。

谢谢你的回答,可能你没懂我的意思,按你的方法,变成一个输入文件后,没有任何关于我计算的东西了,更不用提我所要的HOMO,LUMO轨道图了,我需要得到的是HOMO等轨道的分布图,并且这个分布图上的配位键能都显示出来。
4楼2012-09-11 08:57:15
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oneil

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 飞行鸟 at 2012-09-11 08:40:44
对,楼上说的很对,复制编辑成新的文件。就可以了。

你好,我不是想要一个优化后的结构图,而是想优化后的轨道分布图,编辑后是没办法查看这些计算后才有的信息的
5楼2012-09-11 08:58:47
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xxjiang

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我也遇到过这种情况,原因可能是你最初输入文件分子的结构与优化后的结构相差太大导致的,建议你在重新调整一下输入结构在重新算一下
6楼2012-09-11 10:58:51
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oneil

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by xxjiang at 2012-09-11 10:58:51
我也遇到过这种情况,原因可能是你最初输入文件分子的结构与优化后的结构相差太大导致的,建议你在重新调整一下输入结构在重新算一下

试过了,而且基组有加大的,还是不行
7楼2012-09-11 16:36:18
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

【答案】应助回帖

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引用回帖:
5楼: Originally posted by oneil at 2012-09-11 08:58:47
你好,我不是想要一个优化后的结构图,而是想优化后的轨道分布图,编辑后是没办法查看这些计算后才有的信息的...

这个问题,在GaussView里确实不好解决。VMD就容易解决,VMD可以先纯粹导入一个分子结构,然后导入你想显示的cube
8楼2012-09-11 17:06:18
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