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daniell251

木虫 (著名写手)
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10楼: Originally posted by daniell251 at 2012-09-07 16:09:35
I'm not the guy who is on computational chemistry major. So what I learned about DFT are all from xiaomuchong. Meanwhile, there is no professor who can teach this specific area, although someone is  ...

correct: there is no professor in my department...
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11楼2012-09-08 12:11:17
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鱼妃

金虫 (著名写手)

挖坑不填
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8楼: Originally posted by 思雨G十年 at 2012-09-08 11:47:45
对的，就是改动%rwf这一行，加大硬盘。如果你把硬盘都用了还是不行的话，只能换方法了。其实“鱼妃”说的对，弱相互作用，DFT方法在基组合适的情况下是能描述的很好的。只是MP2一直被公认为很精确的方法，甚至某些 ...

谢谢思雨夸奖
其实如果他把硬盘都用了还是不行的话，又非要用mp2，倒是不妨用ri
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己所不欲，勿施于人；己所欲者，亦勿施人。无论穷达，但守本分；八风不动，独善自身。
12楼2012-09-08 14:46:51
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鱼妃

金虫 (著名写手)

挖坑不填
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11楼: Originally posted by daniell251 at 2012-09-08 12:11:17
correct: there is no professor in my department......

呵呵 其实 mp2解决弱作用问题 耗时长 精度低
DFT发展了很多方法来计算弱作用问题 耗时短 精度高（这还真不是瞎话，确实精度高于mp2了）
那么哪些DFT能够比较好的描述弱作用问题？
=====以下转载自sobereva的博客========
B97D:Grimme 2007年的，和D2一起提出来的，B97结合了DFT-D2校正，Gaussian09中已经能用。毕竟D3后来被提出来了，而且用更大训练集参数化，B97D就别用了。
revPBE-D3:修改版PBE结合DFT-D3，是GGA-D3中最出色的，对各种问题都很好。当然还是不如色散校正的杂化、双杂化泛函。必须用GGA且可以用色散校正时就用这个。
SSB-D:前面提过了，其作者鼓吹其很好，一些困难体系别的都不灵它灵。我也对此泛函印象不错，但是目前还没有被程序广泛支持。注意SSB-D3在Grimme的PCCP文中的比较中表现并不好，一方面是可能D3不适合它（而适合D2），也可能是训练集不同，也可能是作者鼓吹SSB-D时所用的测试集太小不足以说明问题。这个问题有待继续考察，反正我目前认为SSB-D可以放心用在弱相互作用体系。
M06-2X-D3:即使不用DFT-D，这东西算弱相互作用本身已经不错，而且已被广泛支持，而且还可以把弱相互作用效应引入密度中。用了DFT-D3后，各方面都无敌！无论弱相互作用还是计算反应能、原子化能之类，在Grimme的泛函-D3横评中是杂化泛函里最好的。但是有可能不好收敛，但如果收敛没问题的话，推荐用这个。
PW6B95-D3:色散校正杂化泛函测试里仅次于M06-2X-D3，如果M06-2X-D3使用有问题，就用这个。同样地，各方面都很好，不仅限于弱相互作用好。
ωB97X-D:Head Gordon于2008年弄的，在ωB97X上加了色散校正并重新参数化，其中阻尼系数函数形式与Grimme D2有所不同。在g09可以直接用wB97XD关键词使用之。由于同时拥有LC和色散校正，比较全能，算弱相互作用、TDDFT都很好，热化学计算也是色散校正杂化泛函里很好的。但色散校正并不像Grimme DFT-D那样给原始泛函其它方面也带来好处，ωB97X-D相对于ωB97X只有色散作用有改进，其它无明显改进（可能LC-已经解决了不少中程相关问题，没有DFT-D插足余地了），对TDDFT略微恶化。总之ωB97X-D是很绝妙的，可以放心地用于任何问题（原理上可代替B3LYP，但由于计算速度明显慢，所以酌情使用）。
MP2:算氢键很好，弱相互作用容易高估，即结合得过于稳定，当然，还是比普通DFT好得多。比DFT需要更大的基组，由于已经有了更好的双杂化泛函，就没必要用了。
SCS-MP2:算色散作用比MP2好，达到双杂化泛函的水平，但氢键不如MP2，算反应能颇好。其它方面没比MP2有什么提高。至于其它变种，如SOS-MP2、S2-MP2之类还不如MP2。毕竟双杂化泛函整体表现更好，除非密度泛函不能用，比如SIE问题明显时，才应该用这个。
B2PLYP:最早提出的双杂化泛函。毕竟引入了MP2，弱相互作用好于一般DFT，但不如DFT-D，何况计算耗时明显增加，别用它。
B2PLYP-D3:各方面总是比B2PLYP好，但不一定比最好的杂化泛函-D3更好。不要用。
DSD-BLYP-D3:双杂化泛函DSD-BLYP加上D3色散校正，在四zeta下Grimme号称它是目前综合性能最出色的色散校正泛函，不仅对于弱相互作用，对其它问题也最好。
PWPB95-D3:双杂化泛函，三zeta下它是最棒的色散校正泛函，对各种问题都很好，四zeta下仅次于DSD-BLYP-D3。
CCSD(T):基组外推到CBS时是弱相互作用的金标准。钱多得没处花就用它
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13楼2012-09-08 14:54:58
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鱼妃

金虫 (著名写手)

挖坑不填
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10楼: Originally posted by daniell251 at 2012-09-08 12:09:35
I'm not the guy who is on computational chemistry major. So what I learned about DFT are all from xiaomuchong. Meanwhile, there is no professor who can teach this specific area, although someone is  ...

recent Angewant and Chem. Soc. Rev. (both are from this year.)

现在还有人敢说这话啊？文献的卷期号页码给一下吧
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己所不欲，勿施于人；己所欲者，亦勿施人。无论穷达，但守本分；八风不动，独善自身。
14楼2012-09-08 14:59:03
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主
mp2算远程作用 确实存在又慢又不准的问题
再说了 人家咋说你就咋信啊 您也太……嘿嘿嘿
我在我的文献管理器里随手一翻，就翻出来一大堆文献，这些都是用DFT算远程作用的
S. Grimme, J. Comput. Chem. 2006, 27, 1787
L. Georigk, S. Grimme, J. Chem. Theory Comput. 2011, 7, 291
D. Qi, L. Zhang, L. Wan, L. Zhao, J. Jiang, J. Phys. Chem. A, 2012, 116, 6785
M. Piacenza, S. Grimme, J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 14841
E. Hulkko, T. Kiljunen, T. Kiviniemi, M. Pettersson, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 1050
K. Matsumura, T. Mori, Y. Inoue, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 17076
Z. Zhang, R. Rousseau, J. Gong, B. D. Kay, Z. Dohnalek, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 17926
T. Schwabe, S. Grimme, J.-P. Djukic, J. Am. Chem. Soc., 2009, 131, 14156
W. Sun, Y. Bu, Y. Wang, J. Phys. Chem. C, 2011, 115, 3220
S. Grimme, Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 3430
T. Schwabe, S. Grimme, Phys. Chem. Chem. Phys. 2007, 9, 3397
S. Grimme, C. Muck-Lichtenfeld, J. Antony, J. Phys. Chem. C 2007, 111, 11199
G. A. Shamov, P. H. M. Budzelaar, G. Schreckenbach, J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 477;
S. Janich, R. Frohlich, A. Wakamiya, S. Yamaguchi, E. -U. Wurthwein, Chem. Eur.
J. 2009, 15, 10457;
P. Rydberg, L. Olsen, J. Phys. Chem. A 2009, 113, 11949;
S. Grimme, J. Comput. Chem. 2006, 27, 1787;
U. Salzner, A. Aydin, J. Chem. Theory Comput. 2011, 7, 2568;
T.-K. Hwang, G.-Y. Eom, M.-S. Choi, J. Phys. Chem. B 2011, 115, 10147;
J. Arago, J. C. Sancho-Garcia, E. Orti, D. Beljonne, J. Chem. Theory Comput. 2011, 7, 2068;
H. Choi, Y. C. Park, Y.-H. Kim, Y. S. Lee, J. Am. Chem. Soc. 2011, 133, 2084;
B. Tian, E. S. E. Eriksson, L. A. Eriksson, J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 2086;
R. Nasiri, M. J. Field, M. Zahedi, A. A. Moosavi-Movahedi, J. Phys. Chem. A 2011, 115, 13542.
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15楼2012-09-08 15:13:15
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

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mp2有高估弱相互作用的缺点。如果非要用mp2，那么SCS-MP2解决了一定的问题，如果是在算不动可以用ri-scs-mp2
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16楼2012-09-08 15:15:14
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daniell251

木虫 (著名写手)
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14楼: Originally posted by 鱼妃 at 2012-09-07 18:59:03
recent Angewant and Chem. Soc. Rev. (both are from this year.)

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我所指的远程作用是在金属和金属间的远程作用 不知道鱼妃有什么见解吗
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17楼2012-09-09 02:06:24
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daniell251

木虫 (著名写手)
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15楼: Originally posted by yjcmwgk at 2012-09-07 19:13:15
mp2算远程作用 确实存在又慢又不准的问题
再说了 人家咋说你就咋信啊 您也太……嘿嘿嘿
我在我的文献管理器里随手一翻，就翻出来一大堆文献，这些都是用DFT算远程作用的
S. Grimme, J. Comput. Chem. 2006, 27,  ...

我这不是孤军奋战吗 而且还是ACIE里面的文章 所以姑且认为是可行的 再来小木虫求教
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18楼2012-09-09 02:07:34
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daniell251

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14楼: Originally posted by 鱼妃 at 2012-09-07 18:59:03
recent Angewant and Chem. Soc. Rev. (both are from this year.)

现在还有人敢说这话啊？文献的卷期号页码给一下吧...

文献号是 ACIE 2012, 51, 5924
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19楼2012-09-09 02:08:29
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daniell251

木虫 (著名写手)
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15楼: Originally posted by yjcmwgk at 2012-09-07 19:13:15
mp2算远程作用 确实存在又慢又不准的问题
再说了 人家咋说你就咋信啊 您也太……嘿嘿嘿
我在我的文献管理器里随手一翻，就翻出来一大堆文献，这些都是用DFT算远程作用的
S. Grimme, J. Comput. Chem. 2006, 27,  ...

yjcmwgk 能看一下 ACIE, 2012, 51, 5924 吗 这篇文章说的是Au-Au的远程作用不能被DFT很好的模拟
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20楼2012-09-09 02:09:32
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