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daniell251

木虫 (著名写手)

[求助] mp2报错

现在正在尝试用在gaussian03上采用mp2 计算一些弱作用力
尝试了一下一些输入方法
%chk= filename.chk
%rwf=a, 245MW,b,245MW,c,245MW,d,245MW,e,245MW,f,245MW,g,245MW,h,245MW
%mem=4G
# opt freq mp2(direct)/genecp

或者
%chk= filename.chk
%mem=10G
# opt freq mp2(direct)/genecp

filename

电荷数 多重态
分子坐标  

Au Ag 0
sddall
****
C H 0
tzvp
****

Au Ag 0
sddall

但每次都有报错信息
第一种是
Not enough disk for semidirect, minimum= 212717110
Not enough memory for fully direct, minimum= 328387200
Not enough  resources for E2 calculation

第二种是
Disk-based method using ON**2 memory for167 occupieds at a time
Estimated scratch disk usage=578373325440 words.
Actual scratch disk usage=578157617792 words.
Erroneous write. Write -1 instead of 4096
fd = 4
orig len= 4096 left=4096
g_write

有哪位高人能够帮我解决这个问题吗 谢谢了
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鱼妃

金虫 (著名写手)

挖坑不填

引用回帖:
11楼: Originally posted by daniell251 at 2012-09-08 12:11:17
correct: there is no professor in my department......

呵呵 其实 mp2解决弱作用问题 耗时长 精度低
DFT发展了很多方法来计算弱作用问题 耗时短 精度高(这还真不是瞎话,确实精度高于mp2了)
那么哪些DFT能够比较好的描述弱作用问题?
=====以下转载自sobereva的博客========
B97D:Grimme 2007年的,和D2一起提出来的,B97结合了DFT-D2校正,Gaussian09中已经能用。毕竟D3后来被提出来了,而且用更大训练集参数化,B97D就别用了。
revPBE-D3:修改版PBE结合DFT-D3,是GGA-D3中最出色的,对各种问题都很好。当然还是不如色散校正的杂化、双杂化泛函。必须用GGA且可以用色散校正时就用这个。
SSB-D:前面提过了,其作者鼓吹其很好,一些困难体系别的都不灵它灵。我也对此泛函印象不错,但是目前还没有被程序广泛支持。注意SSB-D3在Grimme的PCCP文中的比较中表现并不好,一方面是可能D3不适合它(而适合D2),也可能是训练集不同,也可能是作者鼓吹SSB-D时所用的测试集太小不足以说明问题。这个问题有待继续考察,反正我目前认为SSB-D可以放心用在弱相互作用体系。
M06-2X-D3:即使不用DFT-D,这东西算弱相互作用本身已经不错,而且已被广泛支持,而且还可以把弱相互作用效应引入密度中。用了DFT-D3后,各方面都无敌!无论弱相互作用还是计算反应能、原子化能之类,在Grimme的泛函-D3横评中是杂化泛函里最好的。但是有可能不好收敛,但如果收敛没问题的话,推荐用这个。
PW6B95-D3:色散校正杂化泛函测试里仅次于M06-2X-D3,如果M06-2X-D3使用有问题,就用这个。同样地,各方面都很好,不仅限于弱相互作用好。
ωB97X-D:Head Gordon于2008年弄的,在ωB97X上加了色散校正并重新参数化,其中阻尼系数函数形式与Grimme D2有所不同。在g09可以直接用wB97XD关键词使用之。由于同时拥有LC和色散校正,比较全能,算弱相互作用、TDDFT都很好,热化学计算也是色散校正杂化泛函里很好的。但色散校正并不像Grimme DFT-D那样给原始泛函其它方面也带来好处,ωB97X-D相对于ωB97X只有色散作用有改进,其它无明显改进(可能LC-已经解决了不少中程相关问题,没有DFT-D插足余地了),对TDDFT略微恶化。总之ωB97X-D是很绝妙的,可以放心地用于任何问题(原理上可代替B3LYP,但由于计算速度明显慢,所以酌情使用)。
MP2:算氢键很好,弱相互作用容易高估,即结合得过于稳定,当然,还是比普通DFT好得多。比DFT需要更大的基组,由于已经有了更好的双杂化泛函,就没必要用了。
SCS-MP2:算色散作用比MP2好,达到双杂化泛函的水平,但氢键不如MP2,算反应能颇好。其它方面没比MP2有什么提高。至于其它变种,如SOS-MP2、S2-MP2之类还不如MP2。毕竟双杂化泛函整体表现更好,除非密度泛函不能用,比如SIE问题明显时,才应该用这个。
B2PLYP:最早提出的双杂化泛函。毕竟引入了MP2,弱相互作用好于一般DFT,但不如DFT-D,何况计算耗时明显增加,别用它。
B2PLYP-D3:各方面总是比B2PLYP好,但不一定比最好的杂化泛函-D3更好。不要用。
DSD-BLYP-D3:双杂化泛函DSD-BLYP加上D3色散校正,在四zeta下Grimme号称它是目前综合性能最出色的色散校正泛函,不仅对于弱相互作用,对其它问题也最好。
PWPB95-D3:双杂化泛函,三zeta下它是最棒的色散校正泛函,对各种问题都很好,四zeta下仅次于DSD-BLYP-D3。
CCSD(T):基组外推到CBS时是弱相互作用的金标准。钱多得没处花就用它
己所不欲,勿施于人;己所欲者,亦勿施人。无论穷达,但守本分;八风不动,独善自身。
13楼2012-09-08 14:54:58
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思雨G十年

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
daniell251: 金币+5, 有帮助 2012-09-08 12:22:47
硬盘分的太小了。加大硬盘吧
要以感性的思想和认识,理性的思考和行动对待科研。
2楼2012-09-08 08:38:50
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daniell251

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 鱼妃 at 2012-09-07 13:00:24
http://hi.baidu.com/qidft/item/f3d560bc65c2e745bb0e1244
如果mp2把你折磨的欲仙欲死,不妨看看这个帖子

nothing help. DFT can do little thing to find out the weak interaction. Thanks though.
4楼2012-09-08 11:25:14
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daniell251

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 思雨G十年 at 2012-09-07 12:38:50
硬盘分的太小了。加大硬盘吧

can you tell more specifically?
Does that mean I need modify this line: %rwf=a, 245MW,b,245MW,c,245MW,d,245MW,e,245MW,f,245MW,g,245MW,h,245MW  ?

Sorry I can't input Chinese on my Linux system. Thank you.
5楼2012-09-08 11:27:05
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