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张玉2008金虫 (小有名气)
胖胖鱼
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[求助]
TGFa基因BamHI和RsaI 两个位点引物设计（欲做PCR-RFLP）
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本人是新手。 欲做TGFa基因TaqI、BamHI和RsaI三个位点的基因多态性与唇腭裂的关系。 目前国内外研究的比较多得是TaqI位点，所以这个的引物就直接参考文献了，但是BamHI和RsaI两个位点国内研究比较少，国外有不少研究，可文献上都没有把引物写出来。 这些天，我也在各论坛上看了很多引物设计的方法，大部分都是知道了SNP，查到序列，然后去设计引物。可是我这两个位点我不知道它的基因序列到底怎么查，到底该如何去设计引物。 急切希望得到大侠的指导。 谢谢 The BamHI polymorphic site is located within exon VI, which codes for the 3' untranslated region. The two BamHI alleles differ by a single point mutation at the restriction site. The RsaI and TaqI polymorphic sites are located within intron V. The two alleles differ at the restriction site, either by a point mutation (RsaI) or by a 4-bp deletion (TaqI). Murray et al. (1986) and Hayward et al. (1987) have demonstrated RFLP for the human TGFa locus, with the restriction endonucleases BamHI (two alleles, 7.0 kbp and 4 kbp), RsaI (two alleles, 1.5 kbp and 1.2 kbp),and TaqI (two alleles, 3.0 kbp and 2.7 kbp). |
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