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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 药学 » 药理学 » 确定靶位！！！求助
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trizol11

木虫 (正式写手)

[求助] 确定靶位！！！求助

在网上查了关于确定靶位的软件autodock，下载后不能用。翻阅文献也没有查到怎么确定靶位，请大侠帮助。或者给点意见也可以，
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任重道远……
1楼 2012-09-05 10:36:33
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)
autodock是用来做分子对接的：即在明确靶点蛋白后，分析小分子和蛋白的作用模式
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trizol11
2楼2012-09-05 20:12:20
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trizol11

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by longdlut at 2012-09-05 20:12:20
autodock是用来做分子对接的：即在明确靶点蛋白后，分析小分子和蛋白的作用模式

嗯，我明白了，谢谢你
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任重道远……
3楼2012-09-06 15:21:08
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trizol11

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by longdlut at 2012-09-05 20:12:20
autodock是用来做分子对接的：即在明确靶点蛋白后，分析小分子和蛋白的作用模式

我怎么给你金币？给你鲜花吧，谢谢你的帮助
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任重道远……
4楼2012-09-06 15:23:23
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liuzhaomin

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
trizol11: 金币+3 2012-09-06 15:26:23
Sybyl软件的surflex-dock也可以  在对接的时候 最好先清楚你的靶点蛋白的晶体结构  从PDB上下载  没有晶体结构的话  最好知道氨基端序列和相似的其它靶点蛋白亚型的晶体 同源模建出结构  然后用小分子往里面对接 可以看打分函数  total score 数值越大  代表小分子与蛋白的作用越强  我也是最近在学习使用  供你参考
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5楼2012-09-06 15:24:33
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trizol11

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by liuzhaomin at 2012-09-06 15:24:33
Sybyl软件的surflex-dock也可以  在对接的时候 最好先清楚你的靶点蛋白的晶体结构  从PDB上下载  没有晶体结构的话  最好知道氨基端序列和相似的其它靶点蛋白亚型的晶体 同源模建出结构  然后用小分子往里面对接 可 ...

谢谢，
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任重道远……
6楼2012-09-06 15:27:12
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