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shuangzi8761

银虫 (著名写手)

[求助] 毛壳纤维素酶基因RT-PCR无带

小弟要从RNA水平反转录到cDNA,然后扩增纤维素酶基因全长,因为这个毛壳属菌的基因组几经公布了,直接设计引物做PCR扩全长即可。但是每次做完RT-PCR,电泳检测均没有目的带,求教各位,是何问题,该如何解决??
附RNA电泳图,和RT-PCR电泳图。
(用的CMC诱导培养基培养菌,培养2-3天,RNA没问题,之前RT-PCR做了45-60度的退火梯度均无带,所有的试剂都是新换的,反转录用了TAKARA和transgen的盒子均无带,引物用DNA做模版能扩出来,说明引物和退火温度没有问题)

RNA 选的第一条 浓度在1800ug/ml 260/280=2.06



前两条为cDNA模版,后一条为DNA模版,试剂和反应条件均一样,2k的maker,目的带800左右
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gaowei706

铁杆木虫 (职业作家)

资深潜水者

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
shuangzi8761: 金币+5, 有帮助 2012-09-05 19:46:20
这种情况有2个可能的原因:1 这个基因在你提RNA的材料里是否表达?
2  反转录是否成功?
逐渐失去棱角
2楼2012-09-05 17:17:07
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shuangzi8761

银虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gaowei706 at 2012-09-05 17:17:07
这种情况有2个可能的原因:1 这个基因在你提RNA的材料里是否表达?
2  反转录是否成功?

我之前认为是反转录的问题 让师哥和别的实验室同学帮忙做了一遍 pcr后还是没带 现在也是考虑可能这个家族的基因没有表达 已经送其他几个家族的基因去合成引物 试一试看看能不能扩出来
3楼2012-09-05 20:33:40
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