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汕头大学海洋科学接受调剂
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虫尾巴

金虫 (正式写手)

小木虫科研闷骚男联盟盟主

[求助] ONIOM方法优化分子筛结构,出现NaN问题,9999错误结束

使用ONIOM3方法优化一个分子筛结构,分子筛的结构是从MS里导入的,我固定了低层和中层的坐标,高层是松弛的。分子筛骨架的边缘位置都是Si原子,补充H原子,Si-H键长设定为1.47埃。进行优化,六个收敛项前五个很快收敛,只有最后一个一直是NaN,望有经验的虫友给予指导!
PS:目前怀疑分子筛骨架的断裂边缘位置应该设置为O,否则Si-H键长1.47有点儿长了。或者我自旋多重度设置不对?电荷设置不对?这些应该影响不到收敛项的吧?
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海纳百川,有容乃大;壁立千仞,无欲则刚。
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虫尾巴

金虫 (正式写手)

小木虫科研闷骚男联盟盟主

自己顶帖。
海纳百川,有容乃大;壁立千仞,无欲则刚。
2楼2012-09-05 22:17:49
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afeihu

木虫 (著名写手)

小虫,帮助顶贴!
随风漂泊,风流激荡!
3楼2012-09-06 21:37:36
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虫尾巴

金虫 (正式写手)

小木虫科研闷骚男联盟盟主

外层边缘的键,由Si-H键改为O-H键后,依然出现NaN问题,我算是没辙了。不知有没有人曾经遇到过此等问题,如何解决的,拜谢。
另外,ONIOM方法中,低中高层的电荷是如何设置的。我都设置的为0,是否有问题,求解答。。。
海纳百川,有容乃大;壁立千仞,无欲则刚。
4楼2012-09-08 09:37:25
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026li

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 虫尾巴 at 2012-09-08 09:37:25
外层边缘的键,由Si-H键改为O-H键后,依然出现NaN问题,我算是没辙了。不知有没有人曾经遇到过此等问题,如何解决的,拜谢。
另外,ONIOM方法中,低中高层的电荷是如何设置的。我都设置的为0,是否有问题,求解答。 ...

我用ONIOM算过,没遇到你的问题,是用Si-H饱和的断键,应该是你分层的地方有问题。
5楼2013-02-05 13:29:33
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lingtao

银虫 (正式写手)

你好,我要把MS中的一个分子筛结构导入Gaussian中,好像在导入后原来的分子筛的周期性没有了,利用Gaussian进行构型优化时,都没有原来的形状了,请问我应该怎样导入Gaussian中?
6楼2013-11-07 17:40:24
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