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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » ONIOM方法优化分子筛结构，出现NaN问题，9999错误结束
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虫尾巴

金虫 (正式写手)

小木虫科研闷骚男联盟盟主

[求助] ONIOM方法优化分子筛结构，出现NaN问题，9999错误结束

使用ONIOM3方法优化一个分子筛结构，分子筛的结构是从MS里导入的，我固定了低层和中层的坐标，高层是松弛的。分子筛骨架的边缘位置都是Si原子，补充H原子，Si-H键长设定为1.47埃。进行优化，六个收敛项前五个很快收敛，只有最后一个一直是NaN，望有经验的虫友给予指导！
PS：目前怀疑分子筛骨架的断裂边缘位置应该设置为O，否则Si-H键长1.47有点儿长了。或者我自旋多重度设置不对？电荷设置不对？这些应该影响不到收敛项的吧？
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海纳百川，有容乃大；壁立千仞，无欲则刚。
1楼 2012-09-04 09:22:46
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虫尾巴

金虫 (正式写手)

小木虫科研闷骚男联盟盟主
自己顶帖。
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海纳百川，有容乃大；壁立千仞，无欲则刚。
2楼2012-09-05 22:17:49
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afeihu

木虫 (著名写手)
小虫，帮助顶贴！
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随风漂泊，风流激荡！
3楼2012-09-06 21:37:36
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虫尾巴

金虫 (正式写手)

小木虫科研闷骚男联盟盟主
外层边缘的键，由Si-H键改为O-H键后，依然出现NaN问题，我算是没辙了。不知有没有人曾经遇到过此等问题，如何解决的，拜谢。
另外，ONIOM方法中，低中高层的电荷是如何设置的。我都设置的为0，是否有问题，求解答。。。
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海纳百川，有容乃大；壁立千仞，无欲则刚。
4楼2012-09-08 09:37:25
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026li

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 虫尾巴 at 2012-09-08 09:37:25
外层边缘的键，由Si-H键改为O-H键后，依然出现NaN问题，我算是没辙了。不知有没有人曾经遇到过此等问题，如何解决的，拜谢。
另外，ONIOM方法中，低中高层的电荷是如何设置的。我都设置的为0，是否有问题，求解答。 ...

我用ONIOM算过，没遇到你的问题，是用Si-H饱和的断键，应该是你分层的地方有问题。
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5楼2013-02-05 13:29:33
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lingtao

银虫 (正式写手)
你好，我要把MS中的一个分子筛结构导入Gaussian中，好像在导入后原来的分子筛的周期性没有了，利用Gaussian进行构型优化时，都没有原来的形状了，请问我应该怎样导入Gaussian中？
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6楼2013-11-07 17:40:24
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