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vanvan

木虫 (小有名气)

[求助] 双岐杆菌16SrDNA同源性比对

小虫最近送几株双歧杆菌PCR产物进行16SrDNA测序,比对结果很让人吃惊,都是志贺氏菌、大肠之类的,万分不解,请高人指点。我用的是通用引物1492R,27F.感激不尽!
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机遇与挑战并存,梦想与困难共生
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小毛孩24

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
vanvan: 金币+2, 有帮助 2012-09-04 12:57:47
双歧杆菌是厌氧菌,lz在培养的过程中可能就已经杂菌污染,p的不是双歧杆菌
建议在提DNA之前先镜检一下菌体
2楼2012-09-02 20:23:29
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vanvan

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小毛孩24 at 2012-09-02 20:23:29
双歧杆菌是厌氧菌,lz在培养的过程中可能就已经杂菌污染,p的不是双歧杆菌
建议在提DNA之前先镜检一下菌体

菌是纯的
机遇与挑战并存,梦想与困难共生
3楼2012-09-04 12:58:40
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小毛孩24

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖


vanvan: 金币+1, 有帮助 2012-09-05 20:08:14
引用回帖:
3楼: Originally posted by vanvan at 2012-09-04 12:58:40
菌是纯的...

菌是纯的,有可能目标菌全都被杂菌替代了
要检查培养条件是不是严格厌氧,检查菌种是不是目标菌,现在的交叉污染很严重
4楼2012-09-04 17:51:57
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吕晓彤

新虫 (初入文坛)

想问一下  我是本科生 明天要送双歧杆菌的PCR扩增的去测序了但是查不到测序长度是多少?我用的引物是27和1492
5楼2014-12-21 21:05:18
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吕晓彤

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 小毛孩24 at 2012-09-02 20:23:29
双歧杆菌是厌氧菌,lz在培养的过程中可能就已经杂菌污染,p的不是双歧杆菌
建议在提DNA之前先镜检一下菌体

想问一下  我是本科生 明天要送双歧杆菌的PCR扩增的去测序了但是查不到测序长度是多少?我用的引物是27和1492
6楼2014-12-21 21:06:41
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