24小时热门版块排行榜    

查看: 1566  |  回复: 7

hy5186681

铁虫 (初入文坛)

[交流] 使用Towhee做NVT模拟时,气液两盒子的hmatrix 大小该怎么设置? 有什么原则或公式么? 已有1人参与

使用Towhee做NVT模拟时,towhhe_input文件中,气液两盒子的hmatrix 大小该怎么设置?
有什么原则或公式么?
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-09-04 13:29:11
根据体系的密度设置
2楼2012-08-31 09:14:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hy5186681

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 043114076 at 2012-08-31 09:14:11
根据体系的密度设置

不太懂,麻烦你简单举个例子吧,谢谢哈
3楼2012-09-03 11:36:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-09-04 13:29:24
引用回帖:
3楼: Originally posted by hy5186681 at 2012-09-03 11:36:22
不太懂,麻烦你简单举个例子吧,谢谢哈...

比如水的密度是1g/ml, 首先求出单位体积(埃^3)内的水分子数,然后根据你想模拟水分子数求出体积,然后再根据体积算出立方体每个边的边长
4楼2012-09-03 12:26:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hy5186681

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 043114076 at 2012-09-03 12:26:14
比如水的密度是1g/ml, 首先求出单位体积(埃^3)内的水分子数,然后根据你想模拟水分子数求出体积,然后再根据体积算出立方体每个边的边长...

懂了,Thanks!
5楼2012-09-03 21:48:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hy5186681

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 043114076 at 2012-09-03 12:26:14
比如水的密度是1g/ml, 首先求出单位体积(埃^3)内的水分子数,然后根据你想模拟水分子数求出体积,然后再根据体积算出立方体每个边的边长...

还想请教你一个问题,
比如说我要用NVT做相平衡模拟,一种分子类型,比如说水吧,两个盒子,共有200分子;
已知模拟温度为T,相平衡时气液密度分别为r1,r2;
请问 初始输入中 怎么确定两个盒子(气相和液相)中气、液分子数分别为多少?
比如50+150,还是100+100等等,请问有什么原则么,谢谢!
6楼2012-09-03 21:57:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-09-04 13:30:04
引用回帖:
6楼: Originally posted by hy5186681 at 2012-09-03 21:57:49
还想请教你一个问题,
比如说我要用NVT做相平衡模拟,一种分子类型,比如说水吧,两个盒子,共有200分子;
已知模拟温度为T,相平衡时气液密度分别为r1,r2;
请问 初始输入中 怎么确定两个盒子(气相和液相)中 ...

我自己的理解应该是每一相的分子数都应该达到收敛,也就是模拟体系的结构和性质需要的最少的分子数目,比较简便的方法是直接用文献中的数。一般气相分子少一些,液相分子需要多一些。
7楼2012-09-04 09:43:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hy5186681

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 043114076 at 2012-09-04 09:43:46
我自己的理解应该是每一相的分子数都应该达到收敛,也就是模拟体系的结构和性质需要的最少的分子数目,比较简便的方法是直接用文献中的数。一般气相分子少一些,液相分子需要多一些。...

噢,自己随便设的哈,Thanks !
8楼2012-09-06 17:33:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 hy5186681 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 人气不行了 +4 fansofjerry 2026-08-21 4/200 2026-08-21 13:00 by arzu_hma
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 什么时候开奖? +7 CrisMessi 2026-08-18 7/350 2026-08-21 12:15 by weiyin
[基金申请] 时间戳又变了 +12 wuchongjun 2026-08-20 18/900 2026-08-21 11:53 by wuchongjun
[基金申请] 科研孤儿太难了 +15 我4大白菜 2026-08-20 16/800 2026-08-21 11:07 by yming1319
[基金申请] 让我中一个面上吧! +10 大萍1987 2026-08-20 12/600 2026-08-21 09:31 by 020100099
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 13/650 2026-08-21 08:30 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +15 医学老男孩 2026-08-20 17/850 2026-08-20 20:35 by CaoLG
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +10 zju2000 2026-08-16 11/550 2026-08-20 20:02 by cl479861084
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 2027广东省杰青 +4 奶牛小黑 2026-08-15 10/500 2026-08-19 11:02 by wanfengnew
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
信息提示
请填处理意见