应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » 求助：relax计算无故停止了！！！
51/1返回列表
查看: 1158  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

cj4566

木虫 (正式写手)

[求助] 求助：relax计算无故停止了！！！

在对一个团簇进行relax计算，不知道为什么在第一圈scf的时候就中断了，大家帮忙看下啊。
     Initial potential from superposition of free atoms
     Check: negative starting charge=   -0.261082

     starting charge  861.99277, renormalised to  862.00000

     negative rho (up, down):  0.261E+00 0.000E+00
     Starting wfc are  560 randomized atomic wfcs

     total cpu time spent up to now is      525.5 secs

     per-process dynamical memory:  1096.3 Mb

     Self-consistent Calculation

     iteration #  1     ecut=    28.00 Ry     beta=0.60
     Davidson diagonalization with overlap

输入文件：
&CONTROL
                 calculation  = 'relax',
                 restart_mode = 'from_scratch',
                 prefix       = "cluster",
                        nstep = 300,
                 pseudo_dir   = "/pkg/suse11/quantum/5.0/pseudo",
                 outdir       = "/home/n7388683/QE/tmp",                 
/
&SYSTEM
                       ibrav = 8,
                   celldm(1) = 60,
                   celldm(2) = 1,
                   celldm(3) = 1.6,
                         nat = 143,
                        ntyp = 6,
                 occupations = 'smearing',
                     degauss = 0.02D0,
                     ecutwfc = 28,
                     ecutrho = 280,
/
&ELECTRONS
                 conv_thr    = 1.D-8,
                 mixing_beta = 0.6,
/
&IONS
                ion_dynamics = 'bfgs',           
/
ATOMIC_SPECIES
   Zn   65.3799972534  Zn.pbe-van.UPF
    O   15.9989995956  O.pbe-van_ak.UPF
    C   12.0109996796  C.pbe-van_bm.UPF
    H    1.0080000162  H.pbe-van_ak.UPF
    N   14.0069999695  N.pbe-van_ak.UPF
    S   32.0600013733  S.pbe-van_bm.UPF
ATOMIC_POSITIONS crystal
  H   0.3614764678415067   0.3260185388037989   0.4903518590461970
  H   0.3501062906446801   0.3215141854882181   0.4389399820757451
  H   0.2340058736165186   0.2398981439435555   0.4525166678750610
  H   0.2446487688014819   0.2455745407646397   0.5039816478113540
  H   0.3801983569171167   0.2835247486476596   0.5665762473794351
  H   0.2941596080923539   0.3764637600498841   0.5239821142905020
  H   0.4208889805495367   0.3464972260594448   0.5889669361504221
  H   0.3348919576108042   0.4388663086257879   0.5454707103471611
  H   0.2577944124655111   0.3034121140223612   0.5765032361447900
  H   0.3236579070582105   0.2007674044515838   0.5285713555723050
  H   0.2286434816276870   0.2476427293656401   0.6100327448282201
  H   0.2934768472200527   0.1440976175011433   0.5620019342803541
  H   0.2145177563847381   0.2570849305516734   0.4067276402010860
  H   0.2238488179795180   0.2562684282605565   0.2728854880014620
  H   0.2713709555380992   0.2700535015581476   0.2310678378427570
  H   0.1624414935535122   0.2838225104930844   0.3195645124390260
  H   0.1591591840896817   0.2824493011269937   0.3569562962436541
  H   0.1925400419917870   0.3222446407643179   0.3400081715212940
  H   0.1832406163330873   0.2014616779117295   0.3575624688250891
  H   0.1872155887398185   0.2007984768844027   0.3201912055270190
  H   0.2331689385510361   0.1858314672426813   0.3410993224459701
  H   0.2268982005173763   0.1952588751395471   0.6404181304692090
  H   0.2458389923414057   0.1414645984577350   0.6480192262859330
  H   0.2836340198679844   0.1827797991952734   0.6377151560585641
  H   0.4216294345483999   0.3964551823247542   0.6194593288710601
  H   0.4127561239672305   0.4537788521378073   0.6228220357495670
  H   0.3675213642325401   0.4178769479665478   0.6179702791933062
  H   0.2816800395687616   0.2431223151903554   0.1546494784565750
  C   0.3333843313341648   0.3072767569202162   0.4822208547345981
  C   0.3268236489967186   0.3044040760238957   0.4529111994962581
  C   0.2910008365583384   0.2803249223991243   0.4410759229128280
  C   0.2618864864344002   0.2592106029650477   0.4604945810726850
  C   0.2679490958668603   0.2621465114725576   0.4898449893263820
  C   0.3039663514673032   0.2862811878521035   0.5015334421584370
  C   0.3343476403349829   0.3256164015100549   0.5435727410188601
  C   0.3702990677314140   0.3175357105037067   0.5620440473497661
  C   0.3220912155285476   0.3696583628513073   0.5380462881126060
  C   0.3931229433429438   0.3526118000076788   0.5746380757187000
  C   0.3452737572763737   0.4051750864639241   0.5502837215550740
  C   0.3809639685504269   0.3968247692623076   0.5688212222610030
  C   0.2925505834165600   0.2561904892062111   0.5501160251072621
  C   0.2657595955447548   0.2685508339388306   0.5732251645037020
  C   0.3025697111108066   0.2109282899498465   0.5462633001141490
  C   0.2492134928059078   0.2368154096579205   0.5923144404399060
  C   0.2857748914384269   0.1790967767002776   0.5648833195643700
  C   0.2590099051900088   0.1916975884765853   0.5881699018505721
  C   0.2837928668994061   0.2772090137367713   0.4102511081853700
  C   0.2452213829364399   0.2651508074674263   0.3957442727653101
  C   0.2928039435753367   0.2781421843307215   0.3571459941271770
  C   0.2502944918738821   0.2656615165835056   0.3657848038547200
  C   0.2203881108092720   0.2562709691024089   0.3400179181854771
  C   0.2531370727043174   0.2655705530834380   0.3156832528804420
  C   0.2947664999097249   0.2781947134944971   0.3266462755371220
  C   0.2523942345671361   0.2649289811605500   0.2859546113462950
  C   0.2932777959884568   0.2770121332489390   0.2733838615809260
  C   0.3004977769912767   0.2789202012709065   0.2436198549388110
  C   0.3376009575727494   0.2899913872970079   0.2276129970679930
  C   0.3370259297085219   0.2896207104842796   0.1960667427757870
  C   0.3789506794244033   0.3025784015624133   0.2399494647647440
  C   0.1805976031849517   0.2886699275377029   0.3390634102425441
  C   0.2048139209744719   0.2073590390350089   0.3396930257514940
  C   0.2506102327072081   0.1701314341046659   0.6347214708879370
  C   0.4016254474220236   0.4239322574237542   0.6125045914276481
  N   0.3103099862467610   0.2892169118585981   0.5311602295803252
  N   0.4126709109377604   0.3128436562700178   0.2500947627412519
  O   0.2769601866364481   0.1233973840925653   0.0610312122511020
  O   0.2221768533031143   0.1233973840925653   0.1220624245022050
  O   0.2221768533031143   0.0350473840925657   0.0813749496681362
  O   0.2769601866364481   0.0350473840925657   0.1424061619192390
  O   0.3865268533031143   0.1233973840925653   0.0610312122511020
  O   0.3317435199697812   0.1233973840925653   0.1220624245022050
  O   0.3317435199697812   0.0350473840925657   0.0813749496681362
  O   0.3865268533031143   0.0350473840925657   0.1424061619192390
  O   0.4960935199697811   0.1233973840925653   0.0610312122511020
  O   0.4413101866364481   0.1233973840925653   0.1220624245022050
  O   0.4413101866364481   0.0350473840925657   0.0813749496681362
  O   0.4960935199697811   0.0350473840925657   0.1424061619192390
  O   0.2769601866364481   0.3000973840925653   0.0610312122511020
  O   0.2221768533031143   0.3000973840925653   0.1220624245022050
  O   0.2221768533031143   0.2117473840925660   0.0813749496681362
  O   0.2769601866364481   0.2117473840925660   0.1424061619192390
  O   0.3865268533031143   0.3000973840925653   0.0610312122511020
  O   0.3317435199697812   0.3000973840925653   0.1220624245022050
  O   0.3317435199697812   0.2117473840925660   0.0813749496681362
  O   0.3865268533031143   0.2117473840925660   0.1424061619192390
  O   0.4960935199697811   0.3000973840925653   0.0610312122511020
  O   0.4413101866364481   0.3000973840925653   0.1220624245022050
  O   0.4413101866364481   0.2117473840925660   0.0813749496681362
  O   0.4960935199697811   0.2117473840925660   0.1424061619192390
  O   0.2769601866364481   0.4767973840925653   0.0610312122511020
  O   0.2221768533031143   0.4767973840925653   0.1220624245022050
  O   0.2221768533031143   0.3884473840925660   0.0813749496681362
  O   0.2769601866364481   0.3884473840925660   0.1424061619192390
  O   0.3865268533031143   0.4767973840925653   0.0610312122511020
  O   0.3317435199697812   0.4767973840925652   0.1220624245022050
  O   0.3317435199697812   0.3884473840925660   0.0813749496681362
  O   0.3865268533031143   0.3884473840925660   0.1424061619192390
  O   0.4960935199697811   0.4767973840925653   0.0610312122511020
  O   0.4413101866364481   0.4767973840925653   0.1220624245022050
  O   0.4413101866364481   0.3884473840925660   0.0813749496681362
  O   0.4960935199697811   0.3884473840925660   0.1424061619192390
  O   0.4055986795436972   0.4288539847247110   0.5821166103818600
  O   0.2445480611153265   0.1579609647296695   0.6053356846517171
  O   0.3703413629576670   0.2882107079559962   0.1810644362217600
  O   0.2955867332791742   0.2884236580587338   0.1849670095275400
  S   0.3275157442282215   0.2890979246318983   0.3859450326932000
  S   0.3334520248662287   0.2893924385621631   0.3004016181606370
Zn   0.2769601866364481   0.0570106726258992   0.0610312122511020
Zn   0.2221768533031143   0.0570106726258992   0.1220624245022050
Zn   0.2221768533031143   0.1453606726258990   0.0813749496681362
Zn   0.2769601866364481   0.1453606726258990   0.1424061619192390
Zn   0.3865268533031143   0.0570106726258992   0.0610312122511020
Zn   0.3317435199697812   0.0570106726258992   0.1220624245022050
Zn   0.3317435199697812   0.1453606726258990   0.0813749496681362
Zn   0.3865268533031143   0.1453606726258990   0.1424061619192390
Zn   0.4960935199697811   0.0570106726258992   0.0610312122511020
Zn   0.4413101866364481   0.0570106726258992   0.1220624245022050
Zn   0.4413101866364481   0.1453606726258990   0.0813749496681362
Zn   0.4960935199697811   0.1453606726258990   0.1424061619192390
Zn   0.2769601866364481   0.2337106726258990   0.0610312122511020
Zn   0.2221768533031143   0.2337106726258990   0.1220624245022050
Zn   0.2221768533031143   0.3220606726258991   0.0813749496681362
Zn   0.2769601866364481   0.3220606726258991   0.1424061619192390
Zn   0.3865268533031143   0.2337106726258990   0.0610312122511020
Zn   0.3317435199697812   0.2337106726258990   0.1220624245022050
Zn   0.3317435199697812   0.3220606726258990   0.0813749496681362
Zn   0.3865268533031143   0.3220606726258990   0.1424061619192390
Zn   0.4960935199697811   0.2337106726258990   0.0610312122511020
Zn   0.4413101866364481   0.2337106726258990   0.1220624245022050
Zn   0.4413101866364481   0.3220606726258990   0.0813749496681362
Zn   0.4960935199697811   0.3220606726258990   0.1424061619192390
Zn   0.2769601866364481   0.4104106726258990   0.0610312122511020
Zn   0.2221768533031143   0.4104106726258990   0.1220624245022050
Zn   0.2221768533031143   0.4987606726258990   0.0813749496681362
Zn   0.2769601866364481   0.4987606726258990   0.1424061619192390
Zn   0.3865268533031143   0.4104106726258990   0.0610312122511020
Zn   0.3317435199697812   0.4104106726258990   0.1220624245022050
Zn   0.3317435199697812   0.4987606726258990   0.0813749496681362
Zn   0.3865268533031143   0.4987606726258990   0.1424061619192390
Zn   0.4960935199697811   0.4104106726258990   0.0610312122511020
Zn   0.4413101866364481   0.4104106726258990   0.1220624245022050
Zn   0.4413101866364481   0.4987606726258990   0.0813749496681362
Zn   0.4960935199697811   0.4987606726258990   0.1424061619192390
K_POINTS automatic
  2 2 1   0 0 0
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-08-24 10:00:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)
不明白为什么cluster模型要用qe算，高斯不挺好的吗
赞一下 回复此楼
6楼2012-08-24 20:55:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

cj4566

木虫 (正式写手)
为啥没人回呢，我觉得可能是k点设置问题，对于团簇的计算，k点应该设成gamma吧，大家来交流下啊。
赞一下 回复此楼
2楼2012-08-24 11:29:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-08-24 16:39:37
cj4566: 金币+5, ★有帮助 2012-08-26 12:33:45
怀疑是内存不够了，k点确实应该设为gamma点
赞一下 回复此楼
3楼2012-08-24 14:51:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cj4566

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 043114076 at 2012-08-24 14:51:05
怀疑是内存不够了，k点确实应该设为gamma点

关于cpu和内存，怎么估算啊。看过手册里的估算方法，但是感觉太复杂了，有没有最初略的估算啊。比如两百多原子，ecut=30，kpoint 2*2*1，大概需要多少cpu多少内存才够啊。我上面的计算用的是64 cpu，200gb内存，楼上提点意见啊，谢谢啦！
赞一下 回复此楼
4楼2012-08-24 15:00:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 284求调剂 +8 天下熯 2026-02-28 8/400 2026-03-02 00:15 by 暮雨星晴
[考研] 材料化工调剂 +12 今夏不夏 2026-03-01 13/650 2026-03-01 23:32 by L135790
[考研] 材料学硕318求调剂 +5 February_Feb 2026-03-01 5/250 2026-03-01 23:31 by L135790
[考研] 材料类求调剂 +10 wana_kiko 2026-02-28 12/600 2026-03-01 22:10 by 海嵙Y
[考研] 高分子化学与物理调剂 +6 好好好1233 2026-02-28 12/600 2026-03-01 19:48 by 好好好1233
[考研] 298求调剂 +6 axyz3 2026-02-28 6/300 2026-03-01 19:00 by 18137688336
[考研] 272求调剂 +6 材紫有化 2026-02-28 6/300 2026-03-01 18:58 by 18137688336
[考研] 291分工科求调剂 +9 science饿饿 2026-03-01 10/500 2026-03-01 18:55 by 18137688336
[考研] 321求调剂一志愿东北林业大学材料与化工英二数二 +4 虫虫虫虫虫7 2026-03-01 7/350 2026-03-01 16:52 by caszguilin
[考研] 0856材料求调剂 +4 麻辣鱿鱼 2026-02-28 4/200 2026-03-01 16:51 by caszguilin
[考研] 化工专硕342，一志愿大连理工大学，求调剂 +3 kyf化工 2026-02-28 4/200 2026-03-01 16:49 by yywzz
[考研] 285求调剂 +8 满头大汗的学生 2026-02-28 8/400 2026-03-01 16:47 by caszguilin
[基金申请] 刚录用，没有期刊号，但是在线可看的论文可以放为代表作吗 10+3 arang1 2026-03-01 3/150 2026-03-01 16:43 by babero
[考研] 求调剂 +6 repeatt?t 2026-02-28 6/300 2026-03-01 14:37 by Sakura绘
[考研] 课题组接收材料类调剂研究生 +3 gaoxiaoniuma 2026-02-28 4/200 2026-03-01 14:30 by jjj三跨
[考研] 298求调剂 +9 人间唯你是清欢 2026-02-28 12/600 2026-03-01 14:23 by Ducount.Y
[考研] 302材料工程求调剂 +4 Doleres 2026-03-01 5/250 2026-03-01 11:52 by liqiongjy
[考研] 317一志愿华南理工电气工程求调剂 +6 Soliloquy_Q 2026-02-28 11/550 2026-03-01 11:14 by 歌liekkas
[考博] 博士自荐 +4 kkluvs 2026-02-28 4/200 2026-03-01 10:19 by 馥安馥安
[高分子] 求环氧树脂研发1名 +3 孙xc 2026-02-25 11/550 2026-02-28 16:57 by ichall
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭