24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1202  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

cj4566

木虫 (正式写手)

[求助] 求助:relax计算无故停止了!!!

在对一个团簇进行relax计算,不知道为什么在第一圈scf的时候就中断了,大家帮忙看下啊。
     Initial potential from superposition of free atoms
     Check: negative starting charge=   -0.261082

     starting charge  861.99277, renormalised to  862.00000

     negative rho (up, down):  0.261E+00 0.000E+00
     Starting wfc are  560 randomized atomic wfcs

     total cpu time spent up to now is      525.5 secs

     per-process dynamical memory:  1096.3 Mb

     Self-consistent Calculation

     iteration #  1     ecut=    28.00 Ry     beta=0.60
     Davidson diagonalization with overlap

输入文件:
&CONTROL
                 calculation  = 'relax',
                 restart_mode = 'from_scratch',
                 prefix       = "cluster",
                        nstep = 300,
                 pseudo_dir   = "/pkg/suse11/quantum/5.0/pseudo",
                 outdir       = "/home/n7388683/QE/tmp",                 
/
&SYSTEM
                       ibrav = 8,
                   celldm(1) = 60,
                   celldm(2) = 1,
                   celldm(3) = 1.6,
                         nat = 143,
                        ntyp = 6,
                 occupations = 'smearing',
                     degauss = 0.02D0,
                     ecutwfc = 28,
                     ecutrho = 280,
/
&ELECTRONS
                 conv_thr    = 1.D-8,
                 mixing_beta = 0.6,
/
&IONS
                ion_dynamics = 'bfgs',           
/
ATOMIC_SPECIES
   Zn   65.3799972534  Zn.pbe-van.UPF
    O   15.9989995956  O.pbe-van_ak.UPF
    C   12.0109996796  C.pbe-van_bm.UPF
    H    1.0080000162  H.pbe-van_ak.UPF
    N   14.0069999695  N.pbe-van_ak.UPF
    S   32.0600013733  S.pbe-van_bm.UPF
ATOMIC_POSITIONS crystal
  H   0.3614764678415067   0.3260185388037989   0.4903518590461970
  H   0.3501062906446801   0.3215141854882181   0.4389399820757451
  H   0.2340058736165186   0.2398981439435555   0.4525166678750610
  H   0.2446487688014819   0.2455745407646397   0.5039816478113540
  H   0.3801983569171167   0.2835247486476596   0.5665762473794351
  H   0.2941596080923539   0.3764637600498841   0.5239821142905020
  H   0.4208889805495367   0.3464972260594448   0.5889669361504221
  H   0.3348919576108042   0.4388663086257879   0.5454707103471611
  H   0.2577944124655111   0.3034121140223612   0.5765032361447900
  H   0.3236579070582105   0.2007674044515838   0.5285713555723050
  H   0.2286434816276870   0.2476427293656401   0.6100327448282201
  H   0.2934768472200527   0.1440976175011433   0.5620019342803541
  H   0.2145177563847381   0.2570849305516734   0.4067276402010860
  H   0.2238488179795180   0.2562684282605565   0.2728854880014620
  H   0.2713709555380992   0.2700535015581476   0.2310678378427570
  H   0.1624414935535122   0.2838225104930844   0.3195645124390260
  H   0.1591591840896817   0.2824493011269937   0.3569562962436541
  H   0.1925400419917870   0.3222446407643179   0.3400081715212940
  H   0.1832406163330873   0.2014616779117295   0.3575624688250891
  H   0.1872155887398185   0.2007984768844027   0.3201912055270190
  H   0.2331689385510361   0.1858314672426813   0.3410993224459701
  H   0.2268982005173763   0.1952588751395471   0.6404181304692090
  H   0.2458389923414057   0.1414645984577350   0.6480192262859330
  H   0.2836340198679844   0.1827797991952734   0.6377151560585641
  H   0.4216294345483999   0.3964551823247542   0.6194593288710601
  H   0.4127561239672305   0.4537788521378073   0.6228220357495670
  H   0.3675213642325401   0.4178769479665478   0.6179702791933062
  H   0.2816800395687616   0.2431223151903554   0.1546494784565750
  C   0.3333843313341648   0.3072767569202162   0.4822208547345981
  C   0.3268236489967186   0.3044040760238957   0.4529111994962581
  C   0.2910008365583384   0.2803249223991243   0.4410759229128280
  C   0.2618864864344002   0.2592106029650477   0.4604945810726850
  C   0.2679490958668603   0.2621465114725576   0.4898449893263820
  C   0.3039663514673032   0.2862811878521035   0.5015334421584370
  C   0.3343476403349829   0.3256164015100549   0.5435727410188601
  C   0.3702990677314140   0.3175357105037067   0.5620440473497661
  C   0.3220912155285476   0.3696583628513073   0.5380462881126060
  C   0.3931229433429438   0.3526118000076788   0.5746380757187000
  C   0.3452737572763737   0.4051750864639241   0.5502837215550740
  C   0.3809639685504269   0.3968247692623076   0.5688212222610030
  C   0.2925505834165600   0.2561904892062111   0.5501160251072621
  C   0.2657595955447548   0.2685508339388306   0.5732251645037020
  C   0.3025697111108066   0.2109282899498465   0.5462633001141490
  C   0.2492134928059078   0.2368154096579205   0.5923144404399060
  C   0.2857748914384269   0.1790967767002776   0.5648833195643700
  C   0.2590099051900088   0.1916975884765853   0.5881699018505721
  C   0.2837928668994061   0.2772090137367713   0.4102511081853700
  C   0.2452213829364399   0.2651508074674263   0.3957442727653101
  C   0.2928039435753367   0.2781421843307215   0.3571459941271770
  C   0.2502944918738821   0.2656615165835056   0.3657848038547200
  C   0.2203881108092720   0.2562709691024089   0.3400179181854771
  C   0.2531370727043174   0.2655705530834380   0.3156832528804420
  C   0.2947664999097249   0.2781947134944971   0.3266462755371220
  C   0.2523942345671361   0.2649289811605500   0.2859546113462950
  C   0.2932777959884568   0.2770121332489390   0.2733838615809260
  C   0.3004977769912767   0.2789202012709065   0.2436198549388110
  C   0.3376009575727494   0.2899913872970079   0.2276129970679930
  C   0.3370259297085219   0.2896207104842796   0.1960667427757870
  C   0.3789506794244033   0.3025784015624133   0.2399494647647440
  C   0.1805976031849517   0.2886699275377029   0.3390634102425441
  C   0.2048139209744719   0.2073590390350089   0.3396930257514940
  C   0.2506102327072081   0.1701314341046659   0.6347214708879370
  C   0.4016254474220236   0.4239322574237542   0.6125045914276481
  N   0.3103099862467610   0.2892169118585981   0.5311602295803252
  N   0.4126709109377604   0.3128436562700178   0.2500947627412519
  O   0.2769601866364481   0.1233973840925653   0.0610312122511020
  O   0.2221768533031143   0.1233973840925653   0.1220624245022050
  O   0.2221768533031143   0.0350473840925657   0.0813749496681362
  O   0.2769601866364481   0.0350473840925657   0.1424061619192390
  O   0.3865268533031143   0.1233973840925653   0.0610312122511020
  O   0.3317435199697812   0.1233973840925653   0.1220624245022050
  O   0.3317435199697812   0.0350473840925657   0.0813749496681362
  O   0.3865268533031143   0.0350473840925657   0.1424061619192390
  O   0.4960935199697811   0.1233973840925653   0.0610312122511020
  O   0.4413101866364481   0.1233973840925653   0.1220624245022050
  O   0.4413101866364481   0.0350473840925657   0.0813749496681362
  O   0.4960935199697811   0.0350473840925657   0.1424061619192390
  O   0.2769601866364481   0.3000973840925653   0.0610312122511020
  O   0.2221768533031143   0.3000973840925653   0.1220624245022050
  O   0.2221768533031143   0.2117473840925660   0.0813749496681362
  O   0.2769601866364481   0.2117473840925660   0.1424061619192390
  O   0.3865268533031143   0.3000973840925653   0.0610312122511020
  O   0.3317435199697812   0.3000973840925653   0.1220624245022050
  O   0.3317435199697812   0.2117473840925660   0.0813749496681362
  O   0.3865268533031143   0.2117473840925660   0.1424061619192390
  O   0.4960935199697811   0.3000973840925653   0.0610312122511020
  O   0.4413101866364481   0.3000973840925653   0.1220624245022050
  O   0.4413101866364481   0.2117473840925660   0.0813749496681362
  O   0.4960935199697811   0.2117473840925660   0.1424061619192390
  O   0.2769601866364481   0.4767973840925653   0.0610312122511020
  O   0.2221768533031143   0.4767973840925653   0.1220624245022050
  O   0.2221768533031143   0.3884473840925660   0.0813749496681362
  O   0.2769601866364481   0.3884473840925660   0.1424061619192390
  O   0.3865268533031143   0.4767973840925653   0.0610312122511020
  O   0.3317435199697812   0.4767973840925652   0.1220624245022050
  O   0.3317435199697812   0.3884473840925660   0.0813749496681362
  O   0.3865268533031143   0.3884473840925660   0.1424061619192390
  O   0.4960935199697811   0.4767973840925653   0.0610312122511020
  O   0.4413101866364481   0.4767973840925653   0.1220624245022050
  O   0.4413101866364481   0.3884473840925660   0.0813749496681362
  O   0.4960935199697811   0.3884473840925660   0.1424061619192390
  O   0.4055986795436972   0.4288539847247110   0.5821166103818600
  O   0.2445480611153265   0.1579609647296695   0.6053356846517171
  O   0.3703413629576670   0.2882107079559962   0.1810644362217600
  O   0.2955867332791742   0.2884236580587338   0.1849670095275400
  S   0.3275157442282215   0.2890979246318983   0.3859450326932000
  S   0.3334520248662287   0.2893924385621631   0.3004016181606370
Zn   0.2769601866364481   0.0570106726258992   0.0610312122511020
Zn   0.2221768533031143   0.0570106726258992   0.1220624245022050
Zn   0.2221768533031143   0.1453606726258990   0.0813749496681362
Zn   0.2769601866364481   0.1453606726258990   0.1424061619192390
Zn   0.3865268533031143   0.0570106726258992   0.0610312122511020
Zn   0.3317435199697812   0.0570106726258992   0.1220624245022050
Zn   0.3317435199697812   0.1453606726258990   0.0813749496681362
Zn   0.3865268533031143   0.1453606726258990   0.1424061619192390
Zn   0.4960935199697811   0.0570106726258992   0.0610312122511020
Zn   0.4413101866364481   0.0570106726258992   0.1220624245022050
Zn   0.4413101866364481   0.1453606726258990   0.0813749496681362
Zn   0.4960935199697811   0.1453606726258990   0.1424061619192390
Zn   0.2769601866364481   0.2337106726258990   0.0610312122511020
Zn   0.2221768533031143   0.2337106726258990   0.1220624245022050
Zn   0.2221768533031143   0.3220606726258991   0.0813749496681362
Zn   0.2769601866364481   0.3220606726258991   0.1424061619192390
Zn   0.3865268533031143   0.2337106726258990   0.0610312122511020
Zn   0.3317435199697812   0.2337106726258990   0.1220624245022050
Zn   0.3317435199697812   0.3220606726258990   0.0813749496681362
Zn   0.3865268533031143   0.3220606726258990   0.1424061619192390
Zn   0.4960935199697811   0.2337106726258990   0.0610312122511020
Zn   0.4413101866364481   0.2337106726258990   0.1220624245022050
Zn   0.4413101866364481   0.3220606726258990   0.0813749496681362
Zn   0.4960935199697811   0.3220606726258990   0.1424061619192390
Zn   0.2769601866364481   0.4104106726258990   0.0610312122511020
Zn   0.2221768533031143   0.4104106726258990   0.1220624245022050
Zn   0.2221768533031143   0.4987606726258990   0.0813749496681362
Zn   0.2769601866364481   0.4987606726258990   0.1424061619192390
Zn   0.3865268533031143   0.4104106726258990   0.0610312122511020
Zn   0.3317435199697812   0.4104106726258990   0.1220624245022050
Zn   0.3317435199697812   0.4987606726258990   0.0813749496681362
Zn   0.3865268533031143   0.4987606726258990   0.1424061619192390
Zn   0.4960935199697811   0.4104106726258990   0.0610312122511020
Zn   0.4413101866364481   0.4104106726258990   0.1220624245022050
Zn   0.4413101866364481   0.4987606726258990   0.0813749496681362
Zn   0.4960935199697811   0.4987606726258990   0.1424061619192390
K_POINTS automatic
  2 2 1   0 0 0
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)

不明白为什么cluster模型要用qe算,高斯不挺好的吗
6楼2012-08-24 20:55:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

cj4566

木虫 (正式写手)

为啥没人回呢,我觉得可能是k点设置问题,对于团簇的计算,k点应该设成gamma吧,大家来交流下啊。
2楼2012-08-24 11:29:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-08-24 16:39:37
cj4566: 金币+5, 有帮助 2012-08-26 12:33:45
怀疑是内存不够了,k点确实应该设为gamma点
3楼2012-08-24 14:51:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cj4566

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 043114076 at 2012-08-24 14:51:05
怀疑是内存不够了,k点确实应该设为gamma点

关于cpu和内存,怎么估算啊。看过手册里的估算方法,但是感觉太复杂了,有没有最初略的估算啊。比如两百多原子,ecut=30,kpoint 2*2*1,大概需要多少cpu多少内存才够啊。我上面的计算用的是64 cpu,200gb内存,楼上提点意见啊,谢谢啦!
4楼2012-08-24 15:00:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 313求调剂 +3 海日海日 2026-04-04 3/150 2026-04-05 07:48 by 544594351
[考研] 一志愿北京化工大学,初试成绩350求调剂 +9 沿岸?贝壳 2026-04-04 14/700 2026-04-05 01:09 by 沿岸?贝壳
[考研] 数二 英语一,求调剂,本科学校福建农林大学 +3 五峰尖 2026-03-29 3/150 2026-04-04 23:10 by zhyzzh
[考研] 考研调剂 +6 15615482637 2026-04-04 6/300 2026-04-04 22:43 by yu221
[考研] 求调剂 +4 晟功? 2026-04-03 4/200 2026-04-04 21:58 by hemengdong
[考研] 293分求调剂,外语为俄语 +6 加一一九 2026-03-31 6/300 2026-04-04 14:57 by 聪明的大松鼠
[考研] 22408求调剂 354分 可跨专业 +3 hannnnnnn 2026-04-04 3/150 2026-04-04 14:35 by 土木硕士招生
[考研] 材料295 +13 小英11 2026-04-03 14/700 2026-04-04 09:02 by 来看流星雨10
[考研] 考研调剂 +3 15615482637 2026-04-03 3/150 2026-04-03 22:50 by ms629
[考研] 一志愿中国石油大学化学工程323分求调剂 +4 化工专硕323分 2026-04-03 6/300 2026-04-03 22:12 by dongzh2009
[考研] 学硕机械工程303求调剂 +6 无名所以叫吴明 2026-03-30 7/350 2026-04-03 16:48 by asdfzly
[考研] 求调剂 +4 15064154688 2026-04-03 5/250 2026-04-03 15:07 by zrongyan
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +5 崔wj 2026-04-03 5/250 2026-04-03 15:06 by arrow8852
[考研] 一志愿北京交通大学材料工程总分358 +4 cs0106 2026-04-03 4/200 2026-04-03 13:41 by 百灵童888
[考研] 重庆大学材料与化工085600,初试370+,求求调剂建议 +8 shzhou_ 2026-04-01 9/450 2026-04-03 09:31 by 蓝云思雨
[考研] 293求调剂 +4 珂珂乐 2026-04-02 4/200 2026-04-02 20:10 by 6781022
[考研] 085602化工求调剂(331分) +9 111@127 2026-03-30 9/450 2026-04-02 20:00 by dick_runner
[考研] 085900土木水利336分求调剂 +4 Zhangjiangj 2026-03-31 6/300 2026-04-02 11:40 by 1753564080
[考研] 271求调剂 +15 勒布朗@ 2026-03-31 20/1000 2026-04-02 11:24 by Sammy2
[考研] 085410 一志愿211 22408分数359求调剂 +3 123456789qw 2026-03-31 4/200 2026-04-02 00:06 by 义文wang
信息提示
请填处理意见