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tyssave金虫 (小有名气)
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permut软件输入格式 已有1人参与
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最近要用到permut软件来计算居群内和居群间遗传多样性和遗传分化系数（Hs，Ht），说是要用permut这个软件，看到里面有example inperm输入格式数据的例子，但是不懂这些个数字是怎么得来的，麻烦有懂的人指点一下吧 |
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tyssave
金虫 (小有名气)
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大家好，本人做系统进化方面研究的时候，刚开始也是找不到人，群里问了好多，都不搭理，很纳闷不知为什么这些大侠不肯把知道的东西说出来让我们学习一下，后来才找到一位师兄给指导了一下，但依然不知道该如何系统的学习，所以本人深知系统进化方面软件没人指导的痛苦，由于本人暂时不做系统进化方面的研究了，之前软件的用法也忘得差不多了，本人就把permut的输入格式代表了哪些在此写一下，我也属于半路出家，有些地方可能不准确，希望懂的大侠们能大方一点的告知我们这些菜鸟。 permut里面，不同的数字分别代表变异位点的碱基，A用1 ，G用2，T用3，C用4， 插入缺失为6或9；一行代表一个单倍型，列就是有多少个变异位点；就是说一共只会有5种变异ATCG和缺失；如果列的位数对不齐，随便找一个1到4的数字代替就行了。 |
5楼2014-12-04 08:31:01
2楼2014-06-19 17:30:08
3楼2014-11-20 01:43:41
huakaihuaxie
铜虫 (小有名气)
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- 注册: 2012-02-20
- 性别: MM
- 专业: 植物分类学
4楼2014-12-02 10:53:54
