24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 3034  |  回复: 12

lmzxcom1

金虫 (著名写手)

引用回帖:
10楼: Originally posted by lujunyan1118 at 2012-08-20 22:25:37
哦~这样啊。。有生物实验就不错了,如果MD在能解释可以发不错的文章了

一般就看突变的稳定性什么 RMSF还是比较好的

另外想看突变对运动模式的影响,对动力学轨迹做个PCA也是不错的手段...

您老眼毒,做的是稳定性,所以RMSD,RMSF,SASA都比较合适来考察这个大分子结构。多问一句,不同软件跑的MD都可信么,投文章会不会有一些要注意的地方
11楼2012-08-21 08:05:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lujunyan1118

金虫 (小有名气)

★ ★
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-08-21 11:06:17
引用回帖:
11楼: Originally posted by lmzxcom1 at 2012-08-21 08:05:24
您老眼毒,做的是稳定性,所以RMSD,RMSF,SASA都比较合适来考察这个大分子结构。多问一句,不同软件跑的MD都可信么,投文章会不会有一些要注意的地方...

一般也就文献中常用的那么几种了
Amber,Gromacs,NAMD,Charmm,这些还是公认的比较可靠的。
12楼2012-08-21 08:59:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

相约南药

木虫 (正式写手)

药物上将

【答案】应助回帖


zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-11-17 15:55:24
一般稳定的体系 跑个5ns就完全可以,然后计算下rmsd等就可以了
为了理想不停的奋斗吧
13楼2012-11-16 11:18:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lmzxcom1 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料求调剂 +15 一样YWY 2026-04-05 15/750 2026-04-06 22:42 by chenzhimin
[考研] 化工求调剂! +17 RichLi_ 2026-04-06 17/850 2026-04-06 22:26 by qlm5820
[考研] 材料调剂 +10 一样YWY 2026-04-06 10/500 2026-04-06 21:05 by lbsjt
[考研] 一志愿河北工业大学材料工程,初试344求专硕调剂 +6 15933906766 2026-04-05 6/300 2026-04-06 13:21 by 无际的草原
[考研] 070300化学学硕311分求调剂 +11 梁富贵险中求 2026-04-04 11/550 2026-04-06 10:43 by 蓝云思雨
[考研] 085410人工智能 初试316分 求调剂 +7 残星拂曙 2026-03-31 7/350 2026-04-06 10:09 by 蓝云思雨
[考研] 301求调剂 +6 细胞相关蛋白 2026-04-02 10/500 2026-04-06 08:34 by jp9609
[考研] 生物与医药086000调剂一志愿西北农林320分 +3 美美女士 2026-04-03 3/150 2026-04-05 21:55 by 学员8dgXkO
[考研] 280求调剂 +4 李rien 2026-04-04 4/200 2026-04-05 18:44 by imissbao
[考研] 材料0856 英一数二 323 求调剂 +14 袁sy 2026-04-01 14/700 2026-04-05 18:18 by cql1109
[考研] 一志愿江南大学085501机械工程专硕326分,本科佳木斯大学 +5 顾若浮生 2026-04-03 9/450 2026-04-05 09:57 by 1753564080
[考研] 材料调剂 +11 一样YWY 2026-04-02 13/650 2026-04-04 23:10 by 无际的草原
[考研] 413求调剂 +4 柯某某 2026-03-31 4/200 2026-04-04 22:18 by 学员6BFVa3
[考研] 材料专硕306英一数二 +8 z1z2z3879 2026-03-31 8/400 2026-04-04 22:08 by hemengdong
[考研] 一志愿东北大学085901土木专硕345求调剂 +3 zxt11111 2026-04-04 3/150 2026-04-04 14:21 by 土木硕士招生
[考研] 309求调剂 +6 刘刘刘1231 2026-04-02 7/350 2026-04-04 13:41 by liucky
[考研] 本科985,专业0812分336求调剂 +4 莫莫很行 2026-04-03 4/200 2026-04-03 21:31 by zhq0425
[考研] 求调剂 +7 Aniyaio 2026-04-02 7/350 2026-04-02 16:42 by zzsw+
[考研] 304求调剂 +12 素年祭语 2026-03-31 15/750 2026-04-01 22:41 by peike
[考研] 307分求调剂 +14 (o~o) 2026-03-31 15/750 2026-04-01 20:43 by longlotian
信息提示
请填处理意见