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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 转录因子结合位点的问题
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smilesir

银虫 (小有名气)

[求助] 转录因子结合位点的问题

我想请问一下，我现在正在做一个转录因子，想要知道这个转录因子会调控哪些基因，请问我如何预测并确认哈？？？有没有类似的网站或文章，推荐下哈！！谢谢。
另外，如果在转录因子的基因内含子上存在核苷酸突变，请问其是否会对该转录因子的转录调控作用产生影响？如何影响呢？
新手，求帮助哈！
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1楼 2012-07-30 16:23:37
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robert-RBT

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助，热心的虫虫 2012-07-31 13:36:48
预测并验证转录因子的调控基因比较复杂，目前用的比较多的是CHIP-seq方法。就是通过标签标记转录因子，通过转录因子与基因组DNA交联并酶解后，利用标签抗体将转录因子与结合的DNA序列结合，然后洗脱，通过PCR验证富集DNA片段，然后测序分析。随后通过Real-time PCR筛选可能的调控基因。对重点靶标基因，可以用酵母单杂交验证。网上有很多类似文献。
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2楼2012-07-30 20:42:35
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smilesir

银虫 (小有名气)
另外我想问一点，如果我想研究内含子多态性对基因表达的影响，是不是只要将内含子不同变异型插入荧光素酶报告基因中，然后后续研究即可？
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3楼2012-08-02 17:06:07
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