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celia2012

铜虫 (小有名气)

[求助] 单菌落鉴定 已有1人参与

现在随机挑选出一批菌落进行划线培养得到单菌落,想要拿出去进行16sRNA测序,有些菌落外表形态相似,送出去测序之前,可否有方法进行简单鉴别菌落,避免挑选重复,除了外观区别外~期待解答,希望详细一点,生物方面知识薄弱啊~~
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lanhai6589

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by celia2012 at 2012-07-24 18:41:14
量有点大,BOX-PCR是什么啊,具体怎么做的啊,还能详细说明一下啊,或提供个网站,万分感谢...

网上搜的。
BOX-PCR 指纹图谱分析是建立在PCR 基础上的DNA 指纹图谱分析技术中的一种具有快速、简便的优点,是可以对大量高度相似的菌株进行区分的好方法,但不适合种群的划分。
BOX就是一些菌基因组上的重复序列,对BOX做PCR就可以区分相近菌种.
http://zhidao.baidu.com/question/68463604.html
我们做的时候第一步跟做PCR一样裂解菌,然后再按下面资料的PCR扩增体系和程序走,配2%的琼脂糖凝胶,电泳、照胶、看条带。一些细节我就不说了,大致就这样。
http://www.usm.edu/bst/pdf/BOX-PCR.pdf
这里面需要的仪器PCR仪,电泳槽,凝胶成像仪等,稍微繁琐了些。
12楼2012-07-25 12:53:48
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查看全部 14 个回答

gya89

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
celia2012: 金币+1 2012-07-24 09:44:22
celia2012: 金币+1 2012-07-25 08:59:39
我也是入门  16sRNA前要先测生理生化反应吧
ureveryexperimentisdesigned4u2makeustronger
2楼2012-07-24 09:31:43
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robert-RBT

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
celia2012: 金币+2 2012-07-25 08:59:34
可以先在PAGE上比较16sRNA片段大小,可以初步判断是否是同一种菌。page分辨率要比一般琼脂糖凝胶要高,如果大小一样,基本不用重复测序。
3楼2012-07-24 10:08:52
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baopeng

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
celia2012: 金币+1 2012-07-25 08:59:24
你要测多少株啊?不多的话可以直接去测16s测一个才几十块。
4楼2012-07-24 14:12:06
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