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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 单菌落鉴定
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celia2012

铜虫 (小有名气)

[求助] 单菌落鉴定 已有1人参与

现在随机挑选出一批菌落进行划线培养得到单菌落，想要拿出去进行16sRNA测序，有些菌落外表形态相似，送出去测序之前，可否有方法进行简单鉴别菌落，避免挑选重复，除了外观区别外~期待解答，希望详细一点，生物方面知识薄弱啊~~
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1楼 2012-07-23 21:49:27
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gya89

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
celia2012: 金币+1 2012-07-24 09:44:22
celia2012: 金币+1 2012-07-25 08:59:39
我也是入门  16sRNA前要先测生理生化反应吧
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ureveryexperimentisdesigned4u2makeustronger
2楼2012-07-24 09:31:43
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robert-RBT

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
celia2012: 金币+2 2012-07-25 08:59:34
可以先在PAGE上比较16sRNA片段大小，可以初步判断是否是同一种菌。page分辨率要比一般琼脂糖凝胶要高，如果大小一样，基本不用重复测序。
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3楼2012-07-24 10:08:52
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baopeng

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
celia2012: 金币+1 2012-07-25 08:59:24
你要测多少株啊？不多的话可以直接去测16s测一个才几十块。
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4楼2012-07-24 14:12:06
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
celia2012: 金币+1 2012-07-25 08:59:16
如果一定要比较的话可以做生长曲线试试看，这也只是一个方面。很多物理因素也都可以尝试。
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5楼2012-07-24 15:20:32
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lanhai6589

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
celia2012: 金币+2 2012-07-25 08:59:05
celia2012: 金币+1 2012-07-26 08:51:46
可以先用显微镜观察菌体显微形态是否一样，或者做BOX-PCR，跑胶看条带是否一样，条带不一样则菌不同，这个相对麻烦一点。如果量不多，还不如直接都测序。
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6楼2012-07-24 15:24:24
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celia2012

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by lanhai6589 at 2012-07-24 15:24:24
可以先用显微镜观察菌体显微形态是否一样，或者做BOX-PCR，跑胶看条带是否一样，条带不一样则菌不同，这个相对麻烦一点。如果量不多，还不如直接都测序。

量有点大，BOX-PCR是什么啊，具体怎么做的啊，还能详细说明一下啊，或提供个网站，万分感谢
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7楼2012-07-24 18:41:14
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celia2012

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by robert-RBT at 2012-07-24 10:08:52
可以先在PAGE上比较16sRNA片段大小，可以初步判断是否是同一种菌。page分辨率要比一般琼脂糖凝胶要高，如果大小一样，基本不用重复测序。

刚查了一下PAGE是聚丙烯酰胺凝胶电泳，具体怎么做啊~纠结啊
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8楼2012-07-24 18:47:45
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celia2012

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by baopeng at 2012-07-24 14:12:06
你要测多少株啊？不多的话可以直接去测16s测一个才几十块。

你是不是去测过啊，万一不是单菌落，是不是就测不出来了，量多，怕不都是纯的
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9楼2012-07-24 18:48:40
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森林猫

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
celia2012: 金币+2 2012-07-25 08:58:36
celia2012: 金币+1 2012-07-26 08:51:33
16rDNA测序不需要生理生化鉴定，甚至不需要革兰氏染色。只需要知道是细菌还是真菌，选择不同的测序试剂盒就可以鉴定到种属，并且给出序列。
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10楼2012-07-24 20:17:04
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