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celia2012

铜虫 (小有名气)

[求助] 单菌落鉴定 已有1人参与

现在随机挑选出一批菌落进行划线培养得到单菌落,想要拿出去进行16sRNA测序,有些菌落外表形态相似,送出去测序之前,可否有方法进行简单鉴别菌落,避免挑选重复,除了外观区别外~期待解答,希望详细一点,生物方面知识薄弱啊~~
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gya89

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
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celia2012: 金币+1 2012-07-24 09:44:22
celia2012: 金币+1 2012-07-25 08:59:39
我也是入门  16sRNA前要先测生理生化反应吧
ureveryexperimentisdesigned4u2makeustronger
2楼2012-07-24 09:31:43
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robert-RBT

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
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celia2012: 金币+2 2012-07-25 08:59:34
可以先在PAGE上比较16sRNA片段大小,可以初步判断是否是同一种菌。page分辨率要比一般琼脂糖凝胶要高,如果大小一样,基本不用重复测序。
3楼2012-07-24 10:08:52
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baopeng

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


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celia2012: 金币+1 2012-07-25 08:59:24
你要测多少株啊?不多的话可以直接去测16s测一个才几十块。
4楼2012-07-24 14:12:06
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


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celia2012: 金币+1 2012-07-25 08:59:16
如果一定要比较的话可以做生长曲线试试看,这也只是一个方面。很多物理因素也都可以尝试。
5楼2012-07-24 15:20:32
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lanhai6589

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
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celia2012: 金币+2 2012-07-25 08:59:05
celia2012: 金币+1 2012-07-26 08:51:46
可以先用显微镜观察菌体显微形态是否一样,或者做BOX-PCR,跑胶看条带是否一样,条带不一样则菌不同,这个相对麻烦一点。如果量不多,还不如直接都测序。
6楼2012-07-24 15:24:24
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celia2012

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by lanhai6589 at 2012-07-24 15:24:24
可以先用显微镜观察菌体显微形态是否一样,或者做BOX-PCR,跑胶看条带是否一样,条带不一样则菌不同,这个相对麻烦一点。如果量不多,还不如直接都测序。

量有点大,BOX-PCR是什么啊,具体怎么做的啊,还能详细说明一下啊,或提供个网站,万分感谢
7楼2012-07-24 18:41:14
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celia2012

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by robert-RBT at 2012-07-24 10:08:52
可以先在PAGE上比较16sRNA片段大小,可以初步判断是否是同一种菌。page分辨率要比一般琼脂糖凝胶要高,如果大小一样,基本不用重复测序。

刚查了一下PAGE是聚丙烯酰胺凝胶电泳,具体怎么做啊~纠结啊
8楼2012-07-24 18:47:45
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celia2012

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by baopeng at 2012-07-24 14:12:06
你要测多少株啊?不多的话可以直接去测16s测一个才几十块。

你是不是去测过啊,万一不是单菌落,是不是就测不出来了,量多,怕不都是纯的
9楼2012-07-24 18:48:40
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森林猫

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
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celia2012: 金币+2 2012-07-25 08:58:36
celia2012: 金币+1 2012-07-26 08:51:33
16rDNA测序不需要生理生化鉴定,甚至不需要革兰氏染色。只需要知道是细菌还是真菌,选择不同的测序试剂盒就可以鉴定到种属,并且给出序列。
10楼2012-07-24 20:17:04
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