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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 关于微生物新种的界定（发过新种的进）
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查看: 2008  |  回复: 14
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shiliu2011

木虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by dgm1208 at 2012-07-24 10:59:16
我是先扩16s，测得正反向，然后拼接的，拼接好的序列提交的Eztaxon···...

请教一下正反向测序结果怎样拼接?是指找到重叠区域么?

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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11楼2012-07-25 01:05:53
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05243003

木虫 (正式写手)

蓝色的天

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
dgm1208: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-07-26 09:03:09
调取部分序列，构建一下系统发育树，大于97%的都要选，然后看哪些大于97%的和你在同一个分支上，如果在同一分支的比较多那做的意义就不大了。如果只有两三株倒可以做一下。
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12楼2012-07-25 08:37:35
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dgm1208

银虫 (小有名气)
引用回帖:
12楼: Originally posted by 05243003 at 2012-07-25 08:37:35
调取部分序列，构建一下系统发育树，大于97%的都要选，然后看哪些大于97%的和你在同一个分支上，如果在同一分支的比较多那做的意义就不大了。如果只有两三株倒可以做一下。

亲，以前这样做过么？
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科研路艰辛···
13楼2012-07-26 07:41:39
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05243003

木虫 (正式写手)

蓝色的天

【答案】应助回帖

我都是这么做的，你这相似性在链霉菌里不算太高，先画个树看看吧
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14楼2012-07-26 11:28:01
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小楚丶

新虫 (小有名气)
一般16S小于97才有可能是新种，你这个，我觉得没必要买模式菌种杂交了

发自小木虫Android客户端
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15楼2015-11-14 12:33:31
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