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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 一个4.9kb的质粒以nm为单位的大小问题？
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cilly123

铜虫 (初入文坛)

[求助] 一个4.9kb的质粒以nm为单位的大小问题？

我的质粒是pGenesil-1，大小4.9kb，想请问下它以nm为单位的大小（主要是外径）？我正在做一个铁和质粒DNA连接后靶向肿瘤细胞的实验，考虑到细胞的进入和与铁的连接问题，想了解下此质粒的大小。因为查了好久也没查到资料，只能在这里求助各位高手，希望有了解的能帮忙解答下，非常感谢！
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1楼 2012-07-21 18:50:12
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这个还要根据你质粒的浓度才能算你要的nm。
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2楼2012-07-21 19:11:00
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cilly123

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by reallpf at 2012-07-21 19:11:00
这个还要根据你质粒的浓度才能算你要的nm。

这个。。我没怎么懂楼上的意思。。我想知道的是单个质粒的外径有多少纳米，这个跟浓度有关？
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3楼2012-07-21 21:01:40
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beautybanana

木虫 (著名写手)
如果这个质粒是环形的，我们先把它的总长度计算下，大概为0.34*4.9*1000=1666nm，设它的直径为R，那么R=531nm，这是假设的状态下，实际上DNA周围还有水分子，直径会比这个大些。你自己再思考下吧
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4楼2012-07-22 10:05:39
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by cilly123 at 2012-07-21 21:01:40
这个。。我没怎么懂楼上的意思。。我想知道的是单个质粒的外径有多少纳米，这个跟浓度有关？...

抱歉，以为你问的摩尔浓度，
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5楼2012-07-22 10:10:20
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cilly123

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by beautybanana at 2012-07-22 10:05:39
如果这个质粒是环形的，我们先把它的总长度计算下，大概为0.34*4.9*1000=1666nm，设它的直径为R，那么R=531nm，这是假设的状态下，实际上DNA周围还有水分子，直径会比这个大些。你自己再思考下吧

那直径就差不多1000nm了，应该不会这么大吧，可能DNA构象的改变或其它机制会缩小它的大小，哎，搞不懂，不过还是很感谢你的回答。
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6楼2012-07-22 12:12:21
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cilly123

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by reallpf at 2012-07-22 10:10:20
抱歉，以为你问的摩尔浓度，...

没关系，还是感谢你的回答，不过你是生化专业的都不知道的话，我就迷茫了···
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7楼2012-07-22 12:14:20
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hzlatqh

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
cilly123: 金币+2, ★有帮助 2012-07-23 14:20:48
实际上都不是标准的环形，而是比较扭曲而压缩的，有点像一团扭麻花。。直接测电镜吧，你可以参考附件的图片。。。

supercoiled plasmid DNA
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两个黄鹂鸣翠柳，一行白鹭上青天
8楼2012-07-23 00:18:08
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cilly123

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by hzlatqh at 2012-07-23 00:18:08
实际上都不是标准的环形，而是比较扭曲而压缩的，有点像一团扭麻花。。直接测电镜吧，你可以参考附件的图片。。。
4f/38/578603_1342973827_988.jpg
supercoiled plasmid DNA
...

非常感谢你的回答，那请问你知道它表面有什么可用的化学基团么？如-NH2基团等，我不是生化专业的，搞不懂啊。。开始以为有，后来想想碱基之间配对好像都用掉了，现在就不知道它表面有什么有空的基团可以和磁性纳米连了。希望你或其他生化专业的大侠们了解的话还能帮忙解答下，万分感激。
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9楼2012-07-23 14:19:54
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hzlatqh

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by cilly123 at 2012-07-23 14:19:54
非常感谢你的回答，那请问你知道它表面有什么可用的化学基团么？如-NH2基团等，我不是生化专业的，搞不懂啊。。开始以为有，后来想想碱基之间配对好像都用掉了，现在就不知道它表面有什么有空的基团可以和磁性纳米 ...

http://zh.wikipedia.org/wiki/%E7%A2%B1%E5%9F%BA%E5%AF%B9
C和G上面有NH2，但有氢键，不知道是否影响。具体你看看上面的网址，自己判断一下。。。化学的我不是很懂。。。
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两个黄鹂鸣翠柳，一行白鹭上青天
10楼2012-07-23 17:23:50
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