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[交流]
如何寻找一个20-60个氨基酸寻列的多肽其中含有-ARR-这个结构
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各位大侠 我需要寻找一个20-60个氨基酸寻列的多肽其中含有-ARR-这个结构，我如何去搜索，我对这种搜索一窍不通。 而且我还想知道这个这些蛋白是什么？有什么用？ |
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2楼2012-07-20 19:37:55
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chi247(金币+1): 谢谢参与
chi247: 金币+2 2012-07-21 09:41:07
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http://prosite.expasy.org/scanprosite/ 先建立自己的FASTA序列库TXT文件,然后在Motif(s) to scan for:分析框中输入A-R-R，再选择自己电脑上的序列库文件上传得，得到一个编号，输入为搜索库名，然后进行SCAN.不要选择默认的库，否则会花很多时间搜索网站的库中的序列。 |
5楼2012-07-20 23:51:22
★ ★ ★
chi247(金币+1): 谢谢参与
yqbter: 金币+2, 鼓励发帖！ 2012-07-21 15:55:50
chi247(金币+1): 谢谢参与
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写个perl小程序，用RE来找 /ARR/ 蛋白功能，可以做个BLAST，去www.uniprot.org 或者找序列中的MOTIF，http://www.genome.jp/tools/motif/ 这个是个综合网站，可以同时找PROSITE, PRINTS, Prodom,Pfam,BLOCKS等 |
6楼2012-07-21 03:24:02
7楼2012-07-21 08:21:07
8楼2012-07-21 12:54:05
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2012-07-20 22:41
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chi247(金币+1): 谢谢参与
