应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 如何寻找一个20-60个氨基酸寻列的多肽其中含有-ARR-这个结构
81/1返回列表
查看: 1678  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

chi247

木虫 (小有名气)

[交流] 如何寻找一个20-60个氨基酸寻列的多肽其中含有-ARR-这个结构

各位大侠

我需要寻找一个20-60个氨基酸寻列的多肽其中含有-ARR-这个结构，我如何去搜索，我对这种搜索一窍不通。
而且我还想知道这个这些蛋白是什么？有什么用？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2012-07-20 17:53:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖置顶 ( 共有6个 )

userhung

禁虫 (文学泰斗)
★
chi247(金币+1): 谢谢参与
http://wenku.baidu.com/view/2a25a0e9b8f67c1cfad6b8d5.html
赞一下 回复此楼
2楼2012-07-20 19:37:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hugh_hang

至尊木虫 (正式写手)
★ ★ ★
chi247(金币+1): 谢谢参与
yqbter: 金币+2, 鼓励发帖！ 2012-07-21 15:55:38
你有这个序列还是提到了这种物质？
赞一下 回复此楼
3楼2012-07-20 21:55:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

547star

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
chi247(金币+1): 谢谢参与
chi247: 金币+2 2012-07-21 09:41:07
http://prosite.expasy.org/scanprosite/
先建立自己的FASTA序列库TXT文件,然后在Motif(s) to scan for:分析框中输入A-R-R，再选择自己电脑上的序列库文件上传得，得到一个编号，输入为搜索库名，然后进行SCAN.不要选择默认的库，否则会花很多时间搜索网站的库中的序列。
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2012-07-20 23:51:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★
chi247(金币+1): 谢谢参与
yqbter: 金币+2, 鼓励发帖！ 2012-07-21 15:55:50
写个perl小程序，用RE来找 /ARR/

蛋白功能，可以做个BLAST，去www.uniprot.org
或者找序列中的MOTIF，http://www.genome.jp/tools/motif/ 这个是个综合网站，可以同时找PROSITE, PRINTS, Prodom,Pfam,BLOCKS等
赞一下 回复此楼
6楼2012-07-21 03:24:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chi247

木虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by hugh_hang at 2012-07-20 21:55:27
你有这个序列还是提到了这种物质？

想寻找这样一个序列的多肽，其他人的回答均不具体，我还是不知道怎么去寻找，而编程的我又不会做
赞一下 回复此楼
7楼2012-07-21 08:21:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hugh_hang

至尊木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by chi247 at 2012-07-21 08:21:07
想寻找这样一个序列的多肽，其他人的回答均不具体，我还是不知道怎么去寻找，而编程的我又不会做...

去http://www.ncbi.nlm.nih.gov，点右边BLAST，选protein blast，把你的序列放进去，点"BLAST"，就可以知道你的序列是什么蛋白了
赞一下 回复此楼
8楼2012-07-21 12:54:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
strive1231234楼
2012-07-20 22:41   回复  
chi247(金币+1): 谢谢参与
相关版块跳转 我要订阅楼主 chi247 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭